Question

我有两个文件。 File1包含以下ID：

id/35651
id/35325
id/20993
id/30167
id/29807
id/28315
id/29759
id/27715
id/26884
id/30412

File2包含多个ID，类似于File1的模式，后跟多行描述。现在，我要打印File2中存在的所有带有File1中描述的ID。 File2很大。我在这里有一个较小的版本

>id/30412
GCACACATTTTCTCGCGCTCTCTCCGGCTCTCCTTTGTTTATTTTCTAATCTATATTTTTACTGGAAGAT
TTCCTCTTTATTCTCTCCCGCCCTCCTACAAGCGCTCTTGCTGGCCGTCTGGGTGCACACACCGCTCCCT
CGATCACCCCAGCCCCCTTCCTGGTCTCCCGAGCGCGGGGTTTGAAGGTCACCTCCTTTCCAGTCCCCGT
GCGAGCCGCGCTGCCGCCGCCTCCTCCAGCCAGAGTCGGTGGGACTGGCTGCGCTGCCCTGAAGTGGTTC
TCCAAGCAGCGCGGAGGGTGGCGGACGGCGGACGGAGCCCAGGGGCCGCGTCGGGTGGGGAAACCCGAAC
>id/28315
TCGCGGAGGGGAATCCCTCCCCCTCCGCCCCAGCCCCCCAGCAGCACCCGCGGTGGGGCGGGGGCGCTCT
GCCAGCCCCGGGAACAGCAGAGGCGGCGGCACTGGCTGGACCCACGCGCGCGCCTCCGGGGCTGAAGAAG
GAAGGAGTGAGCCGAGCCGAGCACCCCACATCTGGAGGGGACAGCCAGCCGTGGGCCCCGCCCCGGCGTC
CGGAGCAGGAGAACTCCGAGCTTCTTGCCCAGGCAGAGAGAGCAGGAGCGGACCGCGCGCCCGGGATTGA
>id/2313
GAGTCCTTGCGCTCCAGACCCCCACCCAGTGGCCGCCAGGGTCCCCGCCTGTCCGGACCCTCGCCGCGCC
CAGGCAGGCGCGCCAGGGCGGGGCTGACCTGCCCGCGAAGTTGCGGACAGTGCGTGAGAAACCAGCACCC
CCTTTATGGAAACTGGTCAAAGAACTCATGCAAGTGGAACTTACAGCTTCCTTGATCGGACTCAGCATTC
AGGGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGC
CAGAGTACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTC
>id/26884
CGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCA
CCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGC
ATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAAT
CTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGT
>id/29807
GCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATA
ATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCC
AGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGG
GATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGC
AGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTC
>id/980
AGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGTGTTGTTTACCAGGATGGATTTTATGGTG
CAGACATTTATGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAG
TGACAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGC
GTTGGTGCCATGAATGCTTTTGCACCTTTGACTGATGCCAAGACTAGGAGCCATGCTGATGATGTGGGTC
TCGTTCTTTCTTCATTGCAGGCTAGTATATACCGAGGGGGATACAACCGTTTTGCTCCATACTAAATGAC
AAAACCATAAAAACCTTCCAATGTGGGGAGAAAGGAAGCTTTCCGAGGCCTGAGTATTGCAATACATGCA
GTAGTACATCATTTTAGCAACTCT

我可以使用以下命令一个一个地完成此操作：

sed -n -e '/id\/30412/,/id/p' File2

但是我不确定如何告诉sed从File1获取输入。

还可以不在最后一行中打印匹配的图案id\number吗？

Answer 1

这可能对您有用（GNU sed）：

sed 's|id/\(.*\)|\\#^>id/\1$#{:\1;n;/^>/ba;b\1}|' file1 |
sed -e ':a' -f - -e 'd' file2

从file1构建sed脚本并针对file2运行它。

为每个id建立一个循环，该循环打印当前行，然后获取下一行（n），然后检查该行是否以<开头。如果这样做，脚本会中断:a并检查新的ID，否则它将打印当前行并根据当前ID循环到唯一的占位符，然后继续打印。

与任何ID不匹配的行都将被删除（d）。

从一个文件输入，然后在另一个文件中进行匹配，然后打印直到匹配模式

1 个答案: