在Google Jupyter Notebook上安装CERN ROOT

时间:2019-04-05 22:13:45

标签: google-colaboratory root-framework

我尝试在Google附带的木星笔记本http://root.cern.ch上安装CERN ROOT https://colab.research.google.com。我无法让python与ROOT一起运行,它在以下位置崩溃: 导入根

我一直照常安装ROOT:

!mkdir -p APPS
!pwd
!cd APPS && wget https://root.cern/download/root_v6.16.00.Linux-ubuntu18-x86_64-gcc7.3.tar.gz 
!cd APPS && tar -xf root_v6.16.00.Linux-ubuntu18-x86_64-gcc7.3.tar.gz

!ls APPS/root/bin/thisroot.sh
!source APPS/root/bin/thisroot.sh
!echo $ROOTSYS
!echo $PYTHONPATH

import ROOT

脚本APPS / root / bin / thisroot.sh应该定义PYTHONPATH和ROOTSYS变量,因此应该允许从python使用ROOT。

问题: 运行此脚本后,未设置环境变量,因此无法使用python运行ROOT。

那么,如何设置这些变量??

谢谢, 马辛

1 个答案:

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我也尝试在Google colajuatory Jupiter笔记本上使用ROOT,我发现在导入ROOT之前应先加载一些库。以下代码至少在我的笔记本中有效。

!mkdir -p APPS
!pwd
!cd APPS && wget https://root.cern.ch/download/root_v6.13.08.Linux-ubuntu18-x86_64-gcc7.3.tar.gz 
!cd APPS && tar -xf root_v6.13.08.Linux-ubuntu18-x86_64-gcc7.3.tar.gz

import sys
sys.path.append("/content/APPS/root/lib")
import ctypes
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libCore.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libThread.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libImt.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libRIO.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libNet.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libTree.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libMathCore.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libMatrix.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libHist.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libGraf.so')
import ROOT

h = ROOT.TH1F("gauss","Example histogram",100,-4,4)
h.FillRandom("gaus")
c = ROOT.TCanvas("myCanvasName","The Canvas Title",800,600)
h.Draw()
c.Draw()

如果使用ROOT v6.16.00,则会看到如下错误。

OSError: /content/APPS/root/lib/libImt.so: undefined symbol: _ZN3tbb10interface78internal20isolate_within_arenaERNS1_13delegate_baseEl

顺便说一下,下面列出了google colaboratory的Ubuntu,gcc和python版本。

Ubuntu 18.04.2 LTS (Bionic Beaver)
gcc version 7.3.0 (Ubuntu 7.3.0-27ubuntu1~18.04) 
python 2.7.15rc1 (default, Nov 12 2018, 14:31:15)