Question

我正在尝试从R脚本中自动化一些基本的git操作。我在Windows OS上使用Rstudio。例如，如果您希望在脚本完成一些自动化任务后更新GitHub，这可能会有所帮助。

我编写了一些简单的函数，这些函数利用R的shell()函数和Window的&管道运算符将命令链发送到OS终端：

# Git status.
gitstatus <- function(dir = getwd()){
  cmd_list <- list(
    cmd1 = tolower(substr(dir,1,2)),
    cmd2 = paste("cd",dir),
    cmd3 = "git status"
  )
  cmd <- paste(unlist(cmd_list),collapse = " & ")
  shell(cmd)
}

# Git add.
gitadd <- function(dir = getwd()){
  cmd_list <- list(
    cmd1 = tolower(substr(dir,1,2)),
    cmd2 = paste("cd",dir),
    cmd3 = "git add --all"
  )
  cmd <- paste(unlist(cmd_list),collapse = " & ")
  shell(cmd)
}

# Git commit.
gitcommit <- function(msg = "commit from Rstudio", dir = getwd()){
  cmd_list <- list(
    cmd1 = tolower(substr(dir,1,2)),
    cmd2 = paste("cd",dir),
    cmd3 = paste0("git commit -am ","'",msg,"'")
  )
  cmd <- paste(unlist(cmd_list),collapse = " & ")
  shell(cmd)
}

# Git push.
gitpush <- function(dir = getwd()){
  cmd_list <- list(
    cmd1 = tolower(substr(dir,1,2)),
    cmd2 = paste("cd",dir),
    cmd3 = "git push"
  )
  cmd <- paste(unlist(cmd_list),collapse = " & ")
  shell(cmd)
}

我的gitstatus，gitadd和gitpush函数正常工作。 gitcommit函数不起作用。它会产生以下错误：

致命的：-a路径没有意义。
  警告信息：
  在shell（cmd）中：'d：＆cd D：/ Documents / R / my_path＆git commit -am'commit from Rstudio'执行失败，错误代码为128

gitpush函数之所以起作用，是因为如果您在Rstudio中切换到终端或git，则可以提交更改，然后成功调用gitpush。

关于如何解决此问题的任何想法？

...

注意：：我已经安装了Git bash，并且可以从Windows命令终端和Rstudio成功使用git。我还尝试了另一种策略，即让R写入一个临时.bat文件，然后执行该文件，但是该策略也挂在了提交步骤上。

Answer 1

根据我在this Ask Ubuntu question中所读的内容，应该使用&&而不是&来分隔Git bash中的多个命令。尝试这样做：

gitcommit <- function(msg = "commit from Rstudio", dir = getwd()) {
    cmd_list <- list(
        cmd1 = tolower(substr(dir, 1, 2)),
        cmd2 = paste("cd", dir),
        cmd3 = paste0("git commit -am ", "'", msg, "'")
    )
    cmd <- paste(unlist(cmd_list),collapse = " && ")
    shell(cmd)
}

请注意，您的gitcommit函数将输出如下内容：

/v & cd /var/www/service/usercode/255741827 & git commit -am 'first commit'"

我不知道substr(dir, 1, 2)部分起什么作用，但是如果我的建议仍然不起作用，请尝试将其删除，只留下cd和git commit命令。

Answer 2

解决方案

答案位于Dirk Eddelbuettel's drat 包函数addrepo中。还必须使用git2r's config函数来确保git能够识别R。git2r的函数可能会为将来使用R脚本使用git提供更健壮的解决方案。同时，这是解决问题的方法。

安装git2r。使用git2r :: config（）确保git能够识别R。
从Dirk的代码中，我修改了gitcommit()函数以利用sprintf()和system()执行系统命令：

# Git commit.
gitcommit <- function(msg = "commit from Rstudio", dir = getwd()){
  cmd = sprintf("git commit -m\"%s\"",msg)
  system(cmd)
}

Sprintf的输出如下：

[1] "git commit -m\"commit from Rstudio\""

示例

#install.packages("git2r")
library(git2r)

# Insure you have navigated to a directory with a git repo.
dir <- "mypath"
setwd(dir)

# Configure git.
git2r::config(user.name = "myusername",user.email = "myemail")

# Check git status.
gitstatus()

# Download a file.
url <- "https://i.kym-cdn.com/entries/icons/original/000/002/232/bullet_cat.jpg"
destfile <- "bullet_cat.jpg"
download.file(url,destfile)

# Add and commit changes. 
gitadd()
gitcommit()

# Push changes to github.
gitpush()

好吧，图片看起来很古怪，但是我想你明白了。

Answer 3

我个人喜欢 rOpenSci 的 gert 包的语法和简单性。具体来说，要提交一个回购，你会这样做：

git_add("test.txt")
git_commit("Adding a file", author = "jerry <jerry@gmail.com>")

顶部推送到远程：

git_push(remote = "origin", repo = ".")

并使用这个简单的语法查看所有其他有用的函数。

如何在R脚本中将更改提交到GitHub？

3 个答案:

解决方案

示例