Question

我正在尝试编写一个程序，该程序将搜索一系列字符串，如果找到子字符串的任何部分，则返回true。

例如，说我感兴趣的子字符串是：

GATCGATC

程序应针对以下情况返回True：

GGTGGATCGATC

并且还应返回true（因为它以GATC结尾）：

GGTGTTTTGATC

到目前为止，我有：

def matchpat(str1, str2):
    '''Find a pattern in a string'''
    if str1 in str2:
        return True
    else:
        return False

此函数有效，但仅当存在整个模式时，对于部分匹配，它将返回False。

Answer 1

嗨，我将此代码设为有效。您可以使用变量将其更改为更具动态性

text = 'GGTGGATCGATC'
lookingFor = 'GATCGATC'

def method():
  print('in check')
  if lookingFor in text:
    return true
  else:
    return false

def main():
  method()
  if __name__ == "__main__":

如果要让方法接受输入，可以在方法定义中传递它：

def method(text, lookingFor)

Answer 2

我使用了一个名为Fuzzywuzzy的库来解决类似的问题，该库可以很好地满足我的要求，并且可能会有所帮助。

它使用Levenshtein distance度量标准来比较字符串。

Answer 3

您可以使用re module来完成

import re

patterntomatch = "GATCGATC"
patterntomatch = "[{0}]".format(patterntomatch)

TextTomatch = "This is something"

matchObj = re.match(patterntomatch,TextTomatch,re.I)

if matchObj:
    print ("match found")
else:
    print("no match found")

如何在python中搜索字符串中是否出现子字符串（包括部分匹配项）？

3 个答案: