我对R还是很陌生,所以我希望有人可以帮助我。我的其中一个脚本的输出表是下面的averagetable
,它显示了三个不同群集中事件Standing
的不同比例:
> print(averagetable)
Group.1 Standing
1 cluster1 0.5642857
2 cluster2 0.7795848
3 cluster3 0.7922980
请注意,每次我运行脚本时,R可以为cluster1
上的值分配不同的群集名称(cluster2
,cluster3
或averagetable$Standing
)。另一个输出可以是:
> print(averagetable)
Group.1 Standing
1 cluster1 0.7795848
2 cluster2 0.5642857
3 cluster3 0.7922980
另一方面,我的脚本生成tableresults
数据帧。请在下面找到一个head()
示例:
> head(tableresults)
ACTIVITY_X ACTIVITY_Y ACTIVITY_Z winning_cluster
1 19 21 28 cluster3
2 20 14 24 cluster3
3 34 35 49 cluster3
4 18 5 19 cluster2
5 23 27 35 cluster3
6 33 20 39 cluster3
我的问题很简单。我想根据以下三个规则来更改tableresults
列中的字符串的winning_cluster
中的数据:
1)在Standing
中写入tableresults$wining_cluster
,替换为Standing
中具有最高averagetable
值的集群名称。
2)将Moving/Feeding
写入tableresults$wining_cluster
,并替换为Standing
中具有第二高averagetable
值的集群名称。
3)将Feeding/Moving
中的tableresults$wining_cluster
写入Standing
中具有第三高averagetable
值的集群名称中。
换句话说,这是所需的输出:
> head(tableresults_output)
ACTIVITY_X ACTIVITY_Y ACTIVITY_Z winning_cluster
1 19 21 28 Standing
2 20 14 24 Standing
3 34 35 49 Standing
4 18 5 19 Moving/Feeding
5 23 27 35 Standing
6 33 20 39 Standing
请注意,具有一个基于值的层次结构组件将根据averagetable
值分配条件1)2)或3)非常重要。使用以下方法无法解决此问题:
averagetable$classification <- factor(x = as.character(sort(averagetable$Standing)),
labels = c('Feeding/Moving', 'Moving/Feeding','Standing'))
使用此命令,Standing
将始终链接到cluster1
,Moving/Feeding
会链接到cluster2
,Feeding/Moving
会链接到cluster3
,但这并不一定重新生成averagetable
时为true。
无论如何,我们将不胜感激,希望我的问题对论坛足够有趣。
答案 0 :(得分:0)
只需在第一个classification
中创建您的data.frame
,然后与您的tableresults
合并
averagetable$classification <- factor(x = as.character(sort(averagetable$Standing)),
labels = c('Feeding/Moving', 'Moving/Feeding', 'Standing'))
Group.1 Moving Feeding Standing classification
1: cluster1 0.08214286 0.3216518 0.5642857 Feeding/Moving
2: cluster2 0.04978355 0.1470238 0.7795848 Moving/Feeding
3: cluster3 0.03750000 0.1462121 0.7922980 Standing
merge(tableresults,
averagetable[, c('Group.1', 'classification')],
by.x = 'winning_cluster', by.y = 'Group.1', all.x = T)
winning_cluster ACTIVITY_X ACTIVITY_Y ACTIVITY_Z classification
1: cluster2 18 5 19 Moving/Feeding
2: cluster3 19 21 28 Standing
3: cluster3 20 14 24 Standing
4: cluster3 34 35 49 Standing
5: cluster3 23 27 35 Standing
6: cluster3 33 20 39 Standing
答案 1 :(得分:0)
这是一个刺:
tableresults <- read.table(header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE, text="
ACTIVITY_X ACTIVITY_Y ACTIVITY_Z winning_cluster
1 19 21 28 cluster3
2 20 14 24 cluster3
3 34 35 49 cluster3
4 18 5 19 cluster2
5 23 27 35 cluster3
6 33 20 39 cluster3")
averagetable <- read.table(header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE, text="
Group.1 Standing
1 cluster1 0.5642857
2 cluster2 0.7795848
3 cluster3 0.7922980")
averagetable$x <- c("Standing", "Moving/Feeding", "Feeding/Moving")[ rank(-averagetable$Standing) ]
merge(tableresults, averagetable[,c(1,3)], by.x="winning_cluster", by.y="Group.1")
# winning_cluster ACTIVITY_X ACTIVITY_Y ACTIVITY_Z x
# 1 cluster2 18 5 19 Moving/Feeding
# 2 cluster3 19 21 28 Standing
# 3 cluster3 20 14 24 Standing
# 4 cluster3 34 35 49 Standing
# 5 cluster3 23 27 35 Standing
# 6 cluster3 33 20 39 Standing