Question

我正在处理DNA数据，最简单的形式是带有序列信息的名称/ id：

public class FastaSequence {
    private String name;
    private String sequence;    
{

sequence基本上是ATGGCTATCAC ...，长度为数千个字符。我还可以随时比较其中几百种东西。

我需要能够操纵列和单元格中的字符，例如在JavaFX之类的GUI中选择每个对齐序列的第125个字符，因此我想使用TableView并将sequence转换为字符列表，并将其馈送到表模型中。这样，每个字符都将获得其自己的列，我想将所有包含T的单元格用红色等彩色。

我已经使用Python的TableView进行了尝试，并且得到了一个可以正常工作的原型，但是响应非常慢（加载列表，刷新），即使仅加载了一百个序列的列表也是如此。所以我的问题有两个：

1）即使加载100k或更多的单元格，JavaFX的实现是否也会比Python快很多？

2）我是否吠错了树，是否有更好的方法来查看/操作数据（如上所述）？我应该使用其他模型吗？

更新

我对此进行了更多研究，发现JavaFX中的TableView显然不是为大量列而设计的：https://www.youtube.com/watch?v=udc2iRZBF0M在1:51。

所以我回到了在Swing中测试JTable的过程。没有更多的绒毛，它给了我一个响应能力强（即易于滚动）的表格，最多可容纳1000行1000个字符。但是，使TableModel稍微复杂一点，并使用自定义单元格渲染器将字符置于单元格中并消除单元格边界，从而破坏了响应能力。由于我尝试了很多事情，因此我没有在此处发布所有代码。如果/当我更接近解决方案时，我将使用最少的（有效的）代码进行更新。也许我需要返回一个更简单的控件，例如一个基于网格布局的自定义类，而没有JTable及其模型的开销？

Answer 1

您可以尝试执行以下操作，以将字符串中的所有字符组成数组：

String sequence = "ATGGCTATCAC";
char[] chars = sequence.toCharArray();

然后您可以使用System.out.println(chars[125]);以该顺序打印第125个字符。

我以前从未在JavaFX中使用过表，但我认为您可以执行以下操作：

TableColumn column = new TableColumn("Letter");
table.getColumns().add(column);

root.getChildren.add(table);

ObservableList<Character> data = FXCollections.observableArrayList();

for (int i = 0; i < chars.length; i++) {
    data.add(chars[i]);
}

table.setItems(data);

最好的JavaFx容器，用于按字符处理长字符串char

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