将while读取循环的输出写入Bash Shell中的文本文件

时间:2019-03-22 22:29:06

标签: while-loop output writing

我想将while读取循环的输出保存到文本文件中。

#!/bin/bash
#Written by
#03/22/2019


n=0

while read -r chromosome start end
do
        n=$((n+1))
        echo -e "$chromosome \t $start \t $end \t PeakID_$n"

done < GSEfinal.txt

#There are 63049 lines in GSEfinal.txt

我想将while循环的输出写入一个名为“ ATACpeaks.bed”的文本文件中。

chr1 1000132 1000287 PEAKID_1

chr1 1000444 1000694 PEAKID_2

chry xxxxxx xxxxxx PEAKID_63049

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