Bootstrap t.test:对多个分组级别使用Apply功能

时间:2019-03-21 14:51:29

标签: r dataframe lapply t-test

我需要引导我的“自动” lapply t.test函数来计算Bootstrap统计信息(原始,偏差和标准错误),这是我已经获得的基本t.test代码远(无引导):

# create data
val<-runif(60, min = 0, max = 100)
distance<-floor(runif(60, min=1, max=3))
phase<-rep(c("a", "b", "c"), 20)
color<-rep(c("red", "blue","green","yellow","purple"), 12)

df<-data.frame(val, distance, phase, color)

# run function to obtain t.tests
lapply(split(df, list(df$color, df$phase)), function(d) {
  tryCatch({ t.test(val ~ distance, var.equal=FALSE, data=d) },
       error = function(e) NA)
})

哪个效果很好。但是,我不确定如何将引导方法合并到此apply函数中。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

也许您想要的东西如下所示。请注意,返回值是"htest"类的对象列表的列表(属于列表)或NA

boot_fun <- function(DF){
  n <- nrow(DF)
  i <- sample(n, n, TRUE)
  df <- DF[i, ]
  lapply(split(df, list(df$color, df$phase)), function(d) {
    tryCatch({ t.test(val ~ distance, var.equal=FALSE, data=d) },
             error = function(e) NA)
  })
}

set.seed(1234)
R <- 10
result <- lapply(seq_len(R), function(i) boot_fun(df))