Question

我正在尝试使用R中的熊猫。我使用了网状库。我使用的示例代码如下

library(reticulate) use_condaenv("my_env_37",required=T) py_discover_config() py_run_string("import pandas as pd")

错误

> py_run_string("import pandas as pd")
Error in py_run_string_impl(code, local, convert) :
  ImportError: /lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.21' not found (required by /opt/anaconda/envs/my_env_37/lib/python3.6/site-packages/pandas/_libs/window.cpython-36m-x86_64-linux-gnu.so)

Detailed traceback:
  File "<string>", line 1, in <module>
  File "/opt/anaconda/envs/my_env_37/lib/python3.6/site-packages/pandas/__init__.py", line 42, in <module>
    from pandas.core.api import *
  File "/opt/anaconda/envs/my_env_37/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/api.py", line 26, in <module>
    from pandas.core.groupby import Grouper
  File "/opt/anaconda/envs/my_env_37/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/groupby/__init__.py", line 1, in <module>
    from pandas.core.groupby.groupby import GroupBy  # noqa: F401
  File "/opt/anaconda/envs/my_env_37/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/groupby/groupby.py", line 37, in <module>
    from pandas.core.frame import DataFrame
  File "/opt/anaconda/envs/my_env_37/lib/python3.6/si
Calls: py_run_string -> py_run_string_impl
Execution halted

py_discover_config()的输出


> py_discover_config()
python:         /opt/anaconda/envs/my_env_37/bin/python
libpython:      /opt/anaconda/envs/my_env_37/lib/libpython3.6m.so
pythonhome:     /opt/anaconda/envs/my_env_37:/opt/anaconda/envs/my_env_37
version:        3.6.8 |Anaconda custom (64-bit)| (default, Dec 30 2018, 01:22:34)  [GCC 7.3.0]
numpy:          /opt/anaconda/envs/my_env_37/lib/python3.6/site-packages/numpy
numpy_version:  1.16.2

NOTE: Python version was forced by use_python function

Conda版本：4.6.8 Python版本：3.6.8 熊猫版本：0.24.2 操作系统：RHEL 7.4 R版本：3.5.1 网状版本：1.9

要使此功能正常工作，还有其他配置需要使用吗？当我单独从Python运行相同的熊猫导入时，它按预期运行。

Answer 1

您的GCC似乎太旧了，无法与R模块一起使用。 This issue与R无关，但错误消息相同。

您是否已安装了多个GCC（特别是在/ usr / local中）？如果是这样，您可以尝试我之前给出的链接中建议的类似export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib:/usr/lib:/usr/local/lib64:/usr/lib64的方法。

否则，您应该安装较新版本的GCC（如果仍需要当前版本的GCC，则在模块环境中，有关详细信息，请参见here，IMHO的解释非常清楚）。然后，您将需要在新环境中运行R。

R网状libstdc ++ so找不到GLIBCXX_3.4.21问题

1 个答案: