我无法从未跟踪的更改中删除.Rproj.user文件夹。
我尝试使用git clean -d -f从未跟踪的更改中删除.Rproj.user文件夹。终端响应说它是'Removing .Rproj.user'。但是当我再次运行git status时，.Rproj.user仍列在未跟踪的文件下。
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正如@evolutionxbox所说，您需要忽略此文件夹。这意味着您必须在.gitignore文件中列出它。
您可以手动执行或更好地使用它；
usethis::use_git_ignore(".Rproj.user")
这应该可以解决问题。
要了解有关将git与R结合使用的更多信息，建议您阅读以下网站：happygitwithr.com/