ValueError:X每个样本具有2个功能;期望10

时间:2019-03-18 00:56:05

标签: python classification bioinformatics linear-discriminant

你好,我是编码的初学者,必须做基因分析 我的生物信息学课程。

当我对一些基因进行分类时。我收到以下错误:

File "C:\Users\arthi\Anaconda3\lib\site-packages\sklearn\discriminant_analysis.py", line 514, in predict_proba
prob = self.decision_function(X)

File "C:\Users\arthi\Anaconda3\lib\site-packages\sklearn\linear_model\base.py", line 262, in decision_function
% (X.shape[1], n_features))

 ValueError: X has 2 features per sample; expecting 10

我使用了以下代码:

with open ('Genesdata.pkl', 'rb') as f:
datadict = pickle.load(f)
X_train =  datadict['X_train']
X_test = datadict['X_test']
y_train = datadict['y_train']
y_test = datadict['y_test']
Classifier =  LinearDiscriminantAnalysis()
pred = Classifier.predict(X_test)
acc = accuracy_score(y_test, pred)
error = 1 - acc
print(error)
plot_decision_boundary(X_test,pred,Classifier)`

这是字典的样子:'         {'X_train':array([[2.19006658,-0.73904548,1.0546373,...,2.66134771,          0.98862311,0.44361308],        [0.20861127,-0.93468434,1.67651845,...,0.85252561,         -1.09109426,0.80392969],        [1.42440021,-0.44252457、0.44931581,...,2.24048554,          1.14914253,0.99105977],        ...,        [-1.05716004,-1.05594894,1.33725141,...,0.97913019,          3.47341899,-1.49987541],        [-1.65004305,-0.94600641、0.62179489,...,1.89665973,          3.23602037,1.01596823],        [-0.60023298,-0.578886,-1.28959163,...,0.25218066,          2.59916467,-0.02751579]]),'X_test':数组([[1.83955442,0.78721169,4.13619852,...,1.24837935,          0.81366998,0.99879906],        [2.37883518、1.61882149、1.38400345,...,0.80778427,         -0.17820107,-0.82231867],        [1.89283928,3.3226534,3.51393647,...,1.77412229,         -0.04522057,0.45582996],        ...,        [0.46143703,0.42804519,0.34723485,...,-1.0361394,          0.5680955,0.74929476],        [0.0964557,-0.84329019,-0.98493767,...,0.94844,         -0.42561057,1.92670305],        [1.42933124,1.72959649,-1.0175654,...,1.40912843,          1.20795328,-0.08636293]]),'y_train':array([1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1 ,1、1、1、1        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2],dtype = uint8),'y_test':array([1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1 ,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,        1,1,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,        2,2,2,2],dtype = uint8)}

如果有人能够修复它,我将不胜感激

0 个答案:

没有答案