pygraphviz 1.5默认边缘没有箭头?

时间:2019-03-16 11:25:17

标签: python graphviz pygraphviz

在这里Installing pygraphviz on Windows 10 64-bit, Python 3.6,我已经使用此转轮更新到pygraphviz 1.5。

我遇到了问题。

import pygraphviz as pgv

G = pgv.AGraph()

G.add_node('a')
G.add_node('b')
G.add_edge('a', 'b')
g_string = G.string()

print(g_string)

给我

strict digraph {
    a -- b;
}

在以前的版本1.3中运行了相同的代码

strict digraph {
    a -> b;
}

我什至尝试过

G.add_edge('a', 'b', arrowhead="normal")给出a -- b [arrowhead=normal];,但绘制时没有箭头。

我正在运行graphviz 2.38pygraphviz 1.3在python 2.7上。 pygraphviz 1.5在python 3.6上。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

作为文档state,默认情况下AGraph是无向的。您必须在图形构建期间指定directed=True属性:

>>> G = pgv.AGraph(directed=True)
>>> G.add_node('a')
>>> G.add_node('b')
>>> G.add_edge('a', 'b')
>>> g_string = G.string()
>>>
>>> print(g_string)
strict digraph "" {
    a -> b;
}

答案 1 :(得分:1)

我首先要指出,为了使本示例正常工作,仅安装 PyGraphviz 模块还不够(请选中[SO]: Installing pygraphviz on Windows 10 64-bit, Python 3.6 (@CristiFati's answer)) ,但是还需要 Graphviz 的版本,因为 PyGraphviz 使用其工具之一(称为 nop )。
它是可以下载的,无论如何我还是选择构建它(对于 32bit ,但这无关紧要)。

我还用2个 .whl s进行了测试:

  • 一个(我为) Python 3.6 (64位)
  • 构建的
  • 一个为 Python 2.7 (64位)
  • 构建的

由于我有可能不得不修改它们(出于调试目的),因此我没有pip install,而是将它们解压缩为 cwd (这需要一些额外的代码) ):

[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> dir /b
code.py
pygraphviz131_27
pygraphviz15_36

[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> tree /a
Folder PATH listing for volume Work
Volume serial number is 3655-6FED
E:.
+---pygraphviz131_27
|   \---pygraphviz
|       \---tests
\---pygraphviz15_36
    \---pygraphviz
        \---tests

code.py

#!/usr/bin/env python3

import sys


# @TODO - cfati: The 5 lines below are because I unpacked the 2 `.whl`s in the current dir, instead of `pip install`ing them
maj, min = sys.version_info[:2]
if maj == 3 and min == 6:
    sys.path.insert(0, "pygraphviz15_36")
elif maj == 2 and min == 7:
    sys.path.insert(0, "pygraphviz131_27")
# @TODO end

import pygraphviz as pgv


def main():
    print(pgv)
    g = pgv.AGraph(directed=len(sys.argv) > 1)
    g.add_node("a")
    g.add_node("b")
    g.add_edge("a", "b")
    #print(dir(g))
    g_string = g.string()  # Nice var name, btw :)
    print(g_string)


if __name__ == "__main__":
    print("Python {:s} on {:s}\n".format(sys.version, sys.platform))
    main()

输出

[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> set PATH=%PATH%;e:\Work\Dev\Fati\WinBuild\graphviz\src\graphviz\Release\Graphviz\bin

[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> "e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_02.07.15_test0\Scripts\python.exe" code.py
Python 2.7.15 (v2.7.15:ca079a3ea3, Apr 30 2018, 16:30:26) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)] on win32

<module 'pygraphviz' from 'pygraphviz131_27\pygraphviz\__init__.pyc'>
strict digraph {
        a -> b;
}


[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> "e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_03.06.08_test0\Scripts\python.exe" code.py
Python 3.6.8 (tags/v3.6.8:3c6b436a57, Dec 24 2018, 00:16:47) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)] on win32

<module 'pygraphviz' from 'pygraphviz15_36\\pygraphviz\\__init__.py'>
strict graph "" {
        a -- b;
}

如图所示,该问题很容易重现。现在,输出 - vs。 -> 我将如何表示无向 vs。有向图边。我查看了源代码,发现了一些奇怪的地方。

[GitHub.PyGraphviz 1.5]: class AGraph(thing=None, filename=None, data=None, string=None, handle=None, name='', strict=True, directed=False, **attr)具有directed=False参数。将其设置为 True 即可解决问题。

输出

[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> "e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_02.07.15_test0\Scripts\python.exe" code.py dummy_arg
Python 2.7.15 (v2.7.15:ca079a3ea3, Apr 30 2018, 16:30:26) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)] on win32

<module 'pygraphviz' from 'pygraphviz131_27\pygraphviz\__init__.pyc'>
strict digraph {
        a -> b;
}


[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q055196206]> "e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_03.06.08_test0\Scripts\python.exe" code.py dummy_arg
Python 3.6.8 (tags/v3.6.8:3c6b436a57, Dec 24 2018, 00:16:47) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)] on win32

<module 'pygraphviz' from 'pygraphviz15_36\\pygraphviz\\__init__.py'>
strict digraph "" {
        a -> b;
}

我说我发现了一件奇怪的事情: PyGraphviz 1.3.1 事物是相同的 directed=False (代码文档),但是它以某种方式初始化了图形将其定向
快速检查 agraph.py (在2个软件包版本中)并没有发现差异的来源,因此我可以放心地认为这是由于 Graphviz PyGraphviz 版本的em>软件包版本。

尽管如此, PyGraphviz 1.5 (由我创建)的行为是正确的