Question

两个相关问题：
1.如何在configuration.nix中安装R和选定的软件包？
2.如何不仅从CRAN，而且从Gitub或至少本地存储的软件包中添加软件包？

在Wiki中，您会找到类似的说明来安装R软件包。 https://github.com/NixOS/nixpkgs/blob/master/doc/languages-frameworks/r.section.md。使用nix-shell时可以正常使用，但是在尝试从configuration.nix进行安装时遇到问题。

关于构建R包，我发现了有关构建包的以下示例：

let
  pkgs = import <nixpkgs> {};
  buildRPackage = import <nixpkgs/pkgs/development/r-modules/generic-builder.nix> pkgs.R;
 in
 with pkgs.rPackages;
 {
   foobar = buildRPackage {
     name = "your-package-name-1.0";
     src = ./.;
     propagatedBuildInputs = [/* required dependencies go here */];
   };
 }

The command "nix-build . -A foobar" would then compile it.

但是想将所有从configuration.nix运行到一个位置的机器配置。

Answer 1

好吧，借助上面的Bulats指针，我设法找到了解决方案。在此处找到了完整的示例：https://github.com/NixOS/nixpkgs/issues/44290

为了将来参考，这是在configuration.nix中从CRAN和Github内联添加r包的一种方法：

environment.systemPackages = with pkgs;
   [(pkgs.rWrapper.override {
     packages = with pkgs.rPackages; let
       llr = buildRPackage {
       name = "llr";
       src = pkgs.fetchFromGitHub {
        owner = "dirkschumacher";
        repo = "llr";
        rev = "0a654d469af231e9017e1100f00df47bae212b2c";
        sha256 = "0ks96m35z73nf2sb1cb8d7dv8hq8dcmxxhc61dnllrwxqq9m36lr";};
     propagatedBuildInputs = [ rlang  knitr];
     nativeBuildInputs = [ rlang knitr ];};
    in [knitr
        rlang
        llr
        tidyverse
        ## the rest of your R packages here
        devtools];})
    pkgs.postgresql
    pkgs.isync
    pkgs.msmtp
    pkgs.notmuch
    gnupg
    ## the rest of your Nixos packages (derivations) here
    ];

如何通过configuration.nix安装R和软件包，以及如何从github添加软件包？

1 个答案: