为了简化可重复性,我使用了ResourceSelection包中的SendgridTxEvent[].class
数据集,该数据集包含用于(goats
)和'available'(STATUS == 1
)的空间数据山羊的GPS位置。 STATUS == 0
用于单个(n = 10),ID
,...,ELEVATION
是点的属性。
TASP
我想为library(ResourceSelection)
head(goats)
STATUS ID ELEVATION SLOPE ET ASPECT HLI TASP
1 1 1 651 38.5216 35.3553 243.1131 0.9175926 0.9468804
2 1 1 660 39.6927 70.7107 270.0000 0.8840338 0.6986293
3 1 1 316 20.5477 50.0000 279.2110 0.7131423 0.5749115
4 1 1 334 34.0783 35.3553 266.1859 0.8643775 0.7447368
5 1 1 454 41.6187 25.0000 258.3106 0.9349181 0.8292587
6 1 1 343 28.4694 103.0776 237.0426 0.8254866 0.9756112
(按下面创建)分组的每个人都适合一个glm
,但是模型结构会根据季节而变化。我一直在使用许多有用的SO posts和其他resources,但它们都适合每个组一个模型,而我想为每个Season
分组使用不同的模型。>
Season
下面,我创建一个模型构建函数,并使用#Add a new `Season` field
library(tidyverse)
goats <- goats %>%
mutate(Season = if_else(ID %in% 1:3, "Summer",
if_else(ID %in% 4:7, "Winter", "Fall")))
指定每个季节的特定模型。
if else
然后我尝试将函数映射到分组数据并按如下所示创建新的列表列。
SeasonalMods <- function(df) {
#Models for Archery
if(Season == "Summer") {
glm(STATUS ~ SLOPE + I(SLOPE^2), data = df)
#Models for Winter
} else if (Season == "Winter") {
glm(STATUS ~ SLOPE + ASPECT + TASP, data = df)
#Models for Fall
} else if (Season == "Fall") {
glm(STATUS ~ ELEVATION + SLOPE + ET + ASPECT + HLI + TASP, data = df)}
}
哪个会产生以下错误:
ModelFits <- goats %>%
group_by(Season, ID) %>%
nest() %>%
mutate(fits = map(data, SeasonalMods),
tidied = map(fits, tidy),
glanced = map(fits, glance),
augmented = map(fits, augment))
我不确定如何在Error in mutate_impl(.data, dots) :
Evaluation error: object 'Season' not found
函数中正确指定Season
,以便SeasonalMods
可以解释它。
我试图在map()
和df$
语句中的Season
前面添加if
,但这也会产生错误。
答案 0 :(得分:3)
在我建议使用sudo apt-get install python-httplib2
之后,我继续使用它。就像我在上面说过的那样,您的函数modelr
不知道SeasonalMods
是数据帧中的一列,它作为参数,因此您会得到未定义的错误。替代方法是在函数中添加第二个参数以获取季节。由于您要嵌套数据,因此现在很容易将数据和季节传递给建模函数。我使用Season
是因为列map2
和data
的长度相同。
Season
此函数的所有内部组件都是相同的-我只添加了第二个参数。
library(tidyverse)
library(broom)
仅为了说明您使用的SeasonalMods <- function(df, Season) {
...
}
函数,我添加了broom
列,并将此数据框保存如下:
tidied
只需检查模型在不同季节使用的公式是否不同:
models <- goats %>%
group_by(Season, ID) %>%
nest() %>%
mutate(fits = map2(data, Season, ~SeasonalMods(.x, .y))) %>%
mutate(tidied = map(fits, tidy))
head(models)
#> # A tibble: 6 x 5
#> Season ID data fits tidied
#> <chr> <int> <list> <list> <list>
#> 1 Summer 1 <tibble [2,106 × 7]> <S3: glm> <tibble [3 × 5]>
#> 2 Summer 2 <tibble [1,668 × 7]> <S3: glm> <tibble [3 × 5]>
#> 3 Summer 3 <tibble [1,539 × 7]> <S3: glm> <tibble [3 × 5]>
#> 4 Winter 4 <tibble [951 × 7]> <S3: glm> <tibble [4 × 5]>
#> 5 Winter 5 <tibble [1,908 × 7]> <S3: glm> <tibble [4 × 5]>
#> 6 Winter 6 <tibble [2,184 × 7]> <S3: glm> <tibble [4 × 5]>