Question

我想简化数据库，删除不需要的信息，但是找不到解决方法。这是我的文件示例，在第六栏中，我想删除BPSS之前和之后的所有字符。必须保留与BPSS之前和之后链接的编号。表格示例

bactNOG ENOG410884P     2       2       M       379066.GAU_3228,272560.BPSS2320
bactNOG ENOG4108K54     20      20      S       240016.VspiD_010100004855,530564.Psta_1282,349741.Amuc_1603,272560.BPSS1860,761193.Runsl_3432,320771.Cflav_PD6017 
bactNOG ENOG4108PSW     33      31      E       1048834.TC41_0741,749927.AMED_4235,272560.BPSS0750,479433.Caci_2010,521098.Aaci_0763,220664.PFL_3212,208964.PA1485
bactNOG ENOG4108Q8E     10      9       G       272568.Gdia_0844,349163.Acry_2602,366394.Smed_0916,266834.SMc02021,266835.mll7376,457421.CBFG_05672,272560.BPSS2071

我想将表格简化为此

bactNOG ENOG410884P     2       2       M       272560.BPSS2320
bactNOG ENOG4108K54     20      20      S       272560.BPSS1860
bactNOG ENOG4108PSW     33      31      E       272560.BPSS0750
bactNOG ENOG4108Q8E     10      9       G       272560.BPSS2071

我知道sed中有一些命令，但是这些命令无法帮助我。我已经尝试过像这样的sed命令

sed 's/BPSS[0-9][0-9][0-9][0-9].*/BPSS[0-9][0-9][0-9][0-9]/g' file

但是BPSS之后的数字已更改。我想保留（BPSS）号。

预先感谢

Kamal

Answer 1

$ sed 's/[^[:space:]]*,\([0-9]*\.BPSS[0-9]*\).*/\1/' file
bactNOG ENOG410884P     2       2       M       272560.BPSS2320
bactNOG ENOG4108K54     20      20      S       272560.BPSS1860
bactNOG ENOG4108PSW     33      31      E       272560.BPSS0750
bactNOG ENOG4108Q8E     10      9       G       272560.BPSS2071

sed：删除匹配的第N个字符后的字符

1 个答案: