使用xarray创建netCDF文件,定义变量数据类型

时间:2019-03-11 17:49:13

标签: netcdf python-xarray

我创建了一个带有xarray的netCDF文件,用于将地形高度信息,表面类型信息等输入到数值天气预报模型中。我设法创建了一个文件,但是,该模型要求不同的变量是不同的数据类型。

我的数据集bolund_static如下所示:

shinyServer(function(input, output) {
  observeEvent(input$action,{
    py_run_file("C:/Users/mussa/Sample.py")
  })

使用bolund_static.to_netcdf()保存此数组,它将所有变量保存为double数据类型。我通过创建一个创建的netcdf文件的ncdump获得此信息。

<xarray.Dataset>
Dimensions:          (x: 800, y: 200)

Coordinates:
  * y                (y) float64 1.0 3.0 5.0 7.0 9.0 ... 393.0 395.0 397.0 399.0
  * x                (x) float64 1.0 3.0 5.0 ... 1.595e+03 1.597e+03 1.599e+03
Data variables:
    zt               (y, x) float64 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 ... 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0
    vegetation_type  (y, x) float64 -127.0 -127.0 -127.0 ... -127.0 -127.0
    water_type       (y, x) float64 3.0 3.0 3.0 3.0 3.0 ... 3.0 3.0 3.0 3.0 3.0
    soil_type        (y, x) float64 -127.0 -127.0 -127.0 ... -127.0 -127.0
    pavement_type    (y, x) float64 -127.0 -127.0 -127.0 ... -127.0 -127.0
Attributes:
    version:         1
    origin_z:        0.0
    origin_y:        694682.098
    origin_x:        6177441.825
    origin_lat:      12.098271
    origin_lon:      55.70364
    rotation_angle:  0.0
    palm_version:    6.0
    origin_time:     2019-04-01 12:00:00 +01

导出后,我需要植被类型,水类型,土壤类型和路面类型为NC_BYTE类型,而不是NC_DOUBLE类型,并且x,y,zt为NC_FLOAT。 我将如何更改这些数据类型?在xarray / Python环境中可以做到吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

保存数据集时,您可以使用将输入作为字典的encoding参数。

bolund_static.to_netcdf(filename.nc, encoding={'var1':{'dtype':'int8'}, 'var2':{'dtype':'int8'}})
# replace var1, var2 with your desired variable names
# for NC_float save dtype as int32, for NC_Byte save as int8

您还可以修改变量的其他属性,例如_FillValue等。另一个重要的注意事项是,默认情况下,xarray会自动从最接近的起始时间保存时间单位。如果您想更改它,也可以用相同的方式进行

bolund_static.to_netcdf(filename.nc, encoding={'var1':{'dtype':'int8'},\
'var2':{'dtype':'int8'}, 'origin_time':{'units':'seconds/hours since a 2000-01-01 00:00:00'}})