Question

我需要创建二进制tiff文件（通常为9层，但只有0层很重要）

我得到的结果为布尔numpy 2D数组。但是我无法将它们写成tiff格式。

带有PIL的代码：

res = np.zeros((89262, 208796),dtype=bool)
rois = np.load(endfile)
prediction = np.load(pred)

for i in range(prediction.size):
    if(prediction[i]==1):
        y1, x1, y2, x2 = rois[i].astype(int)
        res[y1:y2,x1:x2] =True

im = PIL.Image.fromarray(res,mode='1')

文件“ /path/to/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/PIL/Image.py”，第812行，以字节为单位 s = d.decode（data）

OverflowError：大小不适合int

带有pyvips的代码

res = np.zeros((89262, 208796),dtype=bool)
rois = np.load(endfile)
prediction = np.load(pred)

for i in range(prediction.size):
    if(prediction[i]==1):
        y1, x1, y2, x2 = rois[i].astype(int)
        res[y1:y2,x1:x2] =True

im = pyvips.Image.new_from_array(res)

文件“ /path/to/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/pyvips/vimage.py”，行291，在new_from_array中 a [x + y *宽度] = array [y] [x]

TypeError：只有大小为1的数组可以转换为Python标量

PS：这是针对Camelyon ACDC LungHP挑战的，以下是确切说明：

提交格式应为TIFF二进制掩码。仅L0级别将用于计算DICE。
必须使用LZW格式压缩TIFF。
参与者必须提交包含50个TIFF口罩的zip文件。每个TIFF文件名都应命名为num_mask.tiff，其中num是测试图像的编号（请参见下文）。

https://acdc-lunghp.grand-challenge.org

从numpy数组创建二进制tiff文件（用lzw压缩）

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