在带有线图的Seaborn FacetGrid中使用单位

Question

以下是针对我的问题的最小，完整且可验证的玩具数据集：

genes = pd.Series(["Gene1"] * 16 + ["Gene2"] * 16)
conditions = pd.Series(np.tile(np.array(["Condition1"] * 8 + ["Condition2"] * 8), 2))
wellID = pd.Series(np.array(["W1"] * 4 + ["W2"] * 4 + ["W3"] * 4 + ["W4"] * 4 + ["W5"] * 4 + ["W6"] * 4 + ["W7"] * 4 + ["W8"] * 4))
fluo = pd.Series(np.array([np.sort(np.random.logistic(size=4)) for _ in range(8)]).flatten())
cycles = pd.Series(np.tile(np.array([0, 1, 2, 3]), 8))
df = pd.concat([genes, conditions, wellID, cycles, fluo], axis=1)
df.columns = ["Gene", "Condition", "WellID", "Cycle", "Fluo"]

它由2个条件的2个基因组成，每个条件有2个重复（1个重复具有1个唯一的WellID，具有4个循环，每个循环1个测得的荧光点）。

我可以使用以下命令创建要隔离一个基因的折线图：

sns.lineplot(x="Cycle", y="Fluo", hue="Condition", units="WellID", estimator=None, data=df.loc[df.Gene == "Gene1"])

我必须同时使用单位和估计量，这样我才能看到2个重复项（而不是每个“基因/条件”的汇总曲线。

最后，我想使用FacetGrid来查看这2个基因的图，所以我这样做了：

g = sns.FacetGrid(df, col="Gene", hue="Condition", col_wrap=5)
g.map(sns.lineplot, "Cycle", "Fluo");

但是如果我有关键字“ units”和“ estimator”，则会出现错误，提示“ ValueError：无法解释输入的'WellID'”。

我只能显示汇总了2个重复项的图。

Answer 1

将其作为args传递给lineplot函数

g = sns.FacetGrid(df, col="Gene", hue="Condition", col_wrap=5)
g.map(sns.lineplot, "Cycle","Fluo", "WellID")
plt.show()