Question

我有带有入口点的Dockerfile：

ENTRYPOINT ["bash", "-c", "source /code/entrypoint.sh | ts '[%Y-%m-%d 
%H:%M:%S]' &>> /output/stderr.log"]

并在entrypoint.sh中输入命令：

fmriprep /input /output participant --fs-license-file 
/opt/freesurfer/license.txt --use-aroma --ignore fieldmaps --n_cpus 12 -- 
force-bbr --participant_label "${ids[@]}" -w /output

我如何在入口点内为命令设置标志，例如将标志--some_flag添加到fmriprep命令以使用

运行它

docker run my_image --some-flag

Answer 1

在触发“ cmd”之前，您应该能够将运行命令中的某些环境变量传递给CMD。为此，请尝试以这种方式使用“ -e”子句（未经测试，但应该可以使用）：

docker run my_image -e 'EXTRA_OPTS=--some-flag'

并在您的命令中：

fmriprep /input /output participant --fs-license-file 
/opt/freesurfer/license.txt --use-aroma --ignore fieldmaps --n_cpus 12 -- 
force-bbr --participant_label "${ids[@]}" -w /output $EXTRA_OPTS

这是基本思想

Answer 2

传递环境变量：

docker run -e flag=somevalue my_image

您可以通过$flag内的Dockerfile访问标志，并将其传递给script

Answer 3

如果您使用ENTRYPOINT的JSON数组形式，那么CMD中的所有内容都将作为命令行参数传递给入口点。

我鼓励不要尝试在Dockerfile或docker-compose.yml文件中内联编写复杂的脚本。编写一个普通脚本，COPY写入图像，然后将该脚本设为ENTRYPOINT。它可以引用shell变量"$@"来运行其CMD。

例如，我可以将脚本重构为：

#!/bin/bash
# I am /entrypoint.sh
"$@" | ts '[%Y-%m-%d %H:%M:%S]' &>> /output/stderr.log

#!/bin/bash
# I am /run.sh
fmriprep /input /output participant --fs-license-file  /opt/freesurfer/license.txt --use-aroma --ignore fieldmaps --n_cpus 12 --force-bbr --participant_label "${ids[@]}" -w /output $EXTRA_OPTS

然后编写一个Dockerfile：

...
COPY entrypoint.sh run.sh /
ENTRYPOINT ["/entrypoint.sh"]
CMD ["/run.sh"]

然后您将开始运行：

docker run my_image /run.sh --some-flag

您还可以运行普通的调试命令，例如：

docker run --rm -it my_image /bin/sh
docker run --rm my_image cat /run.sh

在此特定示例中，我可能会依赖某些外部系统来格式化和捕获日志消息，而不是尝试在容器内部进行操作。例如，将Docker容器日志路由到logstash是一种非常典型的设置。

如何在Docker容器的入口点设置标志

3 个答案: