Question

我在Python中有一个数学优化算法，每次必须评估函数值时，我都必须调用R脚本，在该脚本中编写了仿真代码（基于仿真的优化）。在尝试链接这两个代码之前，我想了解如何链接更容易的东西。假设我有这个小的R脚本：

x <- c(1,2,3,4,5,6)
y <- c(2,3,4,54)
x1 <- mean(x)
y1 <- mean(y)
z <- x1 + y1
print(z)

我想从Spyder（Anaconda）调用它，以便在我的控制台上显示z。我已经阅读了有关rpy2库的信息，但据我了解（如果我输入错了，请更正），我应该用Python编写等效的R代码。有谁知道更简单的方法吗？（我无法在R中很好地编写代码，因此，我将无法翻译我拥有的仿真代码）。如有必要，R作为Anaconda安装在Windows环境中。先感谢您！

Answer 1

尝试了其他几个选项之后，子流程似乎运行良好。您可以通过子进程从Python运行R脚本，并提供函数值作为参数（x）：

def R_script_runner(x):
    import subprocess
    output=subprocess.run(
            ["your_path_to_R_source_folder/Rscript.exe",  "your_path_to_R_script/R_script.R", x], 
                                  shell=True, stdin=subprocess.PIPE,
                                  stdout=subprocess.PIPE,
                                  stderr=subprocess.PIPE).stderr 
    return output

R脚本将执行应做的事情。该函数返回的输出主要用于调试目的，因此您可以打印输出或进行其他评估。

如何从Spyder（python）Anaconda调用R代码？

1 个答案: