从聚结的层级聚类中绘制树状图不会产生预期的结果。我在图像here中附加了预期输出的示例。 y轴显示治疗组。
我的MWE是
library(cluster)
dist<-daisy(cluster, metric = "gower")
kaari <-hclust(dist, method = "ward.D2")
plot(kaari,cex = 0.6, hang = -1)
structure(list(Variety = structure(c(1L,1L,1L,1L,1L,1L, 1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L, 1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L, 1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L, 1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,1L, 1L,1L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L, 2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L, 2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L, 2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L, 2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,3L,3L,3L,3L,3L,3L, 3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L, 3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L, 3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L, 3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,3L, 3L,3L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L, 4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L, 4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L, 4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L, 4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,4L),. Label = c(“ Cal J”, “ Pesa F1”,“ Rambo F1”,“ Riograde”),类=“因子”),Sample.Part =结构(c(3L, 3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L, 4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L, 2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,3L, 3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L, 4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L, 2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,3L, 3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L, 4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L, 2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,3L, 3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L, 4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L, 2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,3L, 3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L, 4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L, 2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,3L, 3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L,2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L, 4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L,3L,3L,3L,3L,3L,3L,2L,2L,2L, 2L,2L,2L,4L,4L,4L,4L,4L,4L,1L,1L,1L,1L,1L,1L),. Label = c(“水果损害百分比”, “中级”,“下级”,“上级”),类=“因子”),总体= c(8.33, 15.83、18.33、18.33、16.67、15.83、17.5、15、14.17、16.67、15 18.33、6.67、14.17、6.67、15.83、10、12.5、10、15、35、55、50, 25、12.5、11.67、12.5、13.33、15.83、13.33、14.17、10、11.67, 15.83、8.33、10.83、7.5、7.5、10.83、9.17、5.83、5.83、10、17.5, 20、12.5、20、5、18.33、15、15、12.5、10、15.83、20.83、15.83, 18.33、10、11.67、18.33、10.83、6.67、7.5、14.17、6.67、10.83, 37.5、17.5、25、15、30、20、24.17、22.5、16.67、19.17、14.17, 24.17、26.67、20.83、16.67、17.5、14.17、20、12.5、20.83、11.67, 6.67、12.5、11.67、55、55、55、60、55、57.5、24.17、28.33、19.17, 21.67,20,18.33,24.17,20.83,17.5,15,16.67,15,15,10.83, 11.67、16.67、14.17、10、30、45、55、42.5、55、37.5、33.33、20.83, 20、17.5、18.33、20、28.33、13.33、17.5、13.33、20.83、11.67, 11.67、10.83、13.33、8.33、8.33、13.33、55、40、55、52.5、45, 45,12.5,17.5,15,21.67,17.5,17.5,14.17,14.17,16.67,14.17, 19.17、15、10.83、13.33、6.67、9.17、8.33、13.33、45、50、40, 35、55、45、10.83、9.17、23.33、22.5、15.83、11.67、26.67、8.33, 20、12.5、10.83、18.33、9.17、7.5、9.17、7.5、5.83、13.33、37.5, 35、45、22.5、30、25、15、13.33、20、13.33、20、20、9.17、21.67, 12.5、10、14.17、24.17、10.83、10、13.33、9.17、11.67、10.83, 45、45、42.5、30、55、40、11.67、21.67、18.33、16.67、16.67, 16.67、14.17、15、15.83、20.83、12.5、16.67、10、12.5、9.17, 10、7.5、6.67、27.5、30、32.5、45、17.5、25、15.83、15.83、17.5, 13.33、12.5、13.33、13.33、10.83、19.17、12.5、13.33、12.5、7.5, 8.33、9.17、5.83、10.83、10.83、47.5、15、20、20、30、30、10, 18.33、12.5、11.67、10.83、13.33、13.33、12.5、10、10、13.33, 15、6.67、14.17、7.5、7.5、10.83、7.5、22.5、15、22.5、20、25, 15)),.Names = c(“ Variety”,“ Sample.Part”,“ overall”),class =“ data.frame”,row.names = c(NA, -288L))
我在数据集中的第一和第二列是分类的,而第三列是数字的,我在此处附加了数据。
Variety Sample.Part overall
Cal J Lower 8.33
Cal J Lower 15.83
Cal J Lower 18.33
Cal J Lower 18.33
Cal J Lower 16.67
Cal J Lower 15.83
Cal J Intermediate 17.50
Cal J Intermediate 15.00
Cal J Intermediate 14.17
Cal J Intermediate 16.67
Cal J Intermediate 15.00
Cal J Intermediate 18.33
Cal J Upper 6.67
Cal J Upper 14.17
Cal J Upper 6.67
Cal J Upper 15.83
Cal J Upper 10.00
Cal J Upper 12.50
Cal J % fruit damage 10.00
Cal J % fruit damage 15.00
Cal J % fruit damage 35.00
Cal J % fruit damage 55.00
Cal J % fruit damage 50.00
我希望第一列中的因子水平在y轴上显示为叶节点。有帮助吗?