R中具有并行cpp函数吗?

时间:2019-03-09 00:32:41

标签: r parallel-processing doparallel

因此,我有2个自定义Rcpp函数CustFunc1(x,y)CustFunc2(a,b)。两者都对计算有要求(因此是c ++)。我的问题是R中是否可以与dopar包同时运行?还是我可以进行系统调用以直接访问cpp代码,并尝试通过某些命令行工具进行并行处理?

现在的流程是:

result1=CustFunc(x,y) ##Takes 20 minutes
result2=CustFunc(a,b) ## Take 20 minutes

get_both <- function(x) {
foreach(i = seq_along(x)) %dopar% {
result1=CustFunc(x,y)
result2=CustFunc(a,b)
}
}
get_both$result1 == result1 #???
get_both$result2 == result2 ##??

1 个答案:

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如果您的函数大约需要20分钟,那么我真的会考虑使用RcppPaallel包重写它们,这并不比直接cpp难得多。这样,您可以使用更多线程,但一次只能运行一个函数。当我用自己的代码执行此操作时,我的计算时间从大约15分钟减少到少于2分钟。