XML数据提取,其中并非所有父节点都包含子节点

时间:2019-03-08 13:25:17

标签: r xml

我有一个xml数据文件,用户在其中打开了一个帐户,在某些情况下该帐户已终止。尚未终止帐户时,数据不会列出值,这使得提取信息非常困难。

这是可复制的示例(只有用户1和3的帐户被终止了):

library(XML)
my_xml <- xmlParse('<accounts>
                    <user>
                      <id>1</id>
                      <start>2015-01-01</start>
                      <termination>2015-01-21</termination>
                    </user>
                    <user>
                      <id>2</id>
                      <start>2015-01-01</start>
                    </user>
                    <user>
                      <id>3</id>
                      <start>2015-02-01</start>
                      <termination>2015-04-21</termination>
                    </user>
                    <user>
                      <id>4</id>
                      <start>2015-03-01</start>
                    </user>
                    <user>
                      <id>5</id>
                      <start>2015-04-01</start>
                    </user>
                    </accounts>')

要创建一个我尝试使用sapply的data.frame,但是由于在用户没有终止值时它不会返回NA,因此代码会生成一个error: arguments imply differing number of rows: 5, 2

accounts <- data.frame(id=sapply(my_xml["//user//id"], xmlValue),
                       start=sapply(my_xml["//user//start"], xmlValue),
                       termination=sapply(my_xml["//user//termination"], xmlValue)
                       )

关于如何解决此问题的任何建议?

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

相对于XML包,我更喜欢使用xml2包,我发现语法更易于使用。这是一个直接的问题。查找所有用户节点,然后解析id和终止节点。使用xml2,如果找不到该节点,xml_find_first函数将返回NA。

library(xml2)
my_xml <- read_xml('<accounts>
                   <user>
                   <id>1</id>
                   <start>2015-01-01</start>
                   <termination>2015-01-21</termination>
                   </user>
                   <user>
                   <id>2</id>
                   <start>2015-01-01</start>
                   </user>
                   <user>
                   <id>3</id>
                   <start>2015-02-01</start>
                   <termination>2015-04-21</termination>
                   </user>
                   <user>
                   <id>4</id>
                   <start>2015-03-01</start>
                   </user>
                   <user>
                   <id>5</id>
                   <start>2015-04-01</start>
                   </user>
                   </accounts>')

usernodes<-xml_find_all(my_xml, ".//user")
ids<-sapply(usernodes, function(n){xml_text(xml_find_first(n, ".//id"))})
terms<-sapply(usernodes, function(n){xml_text(xml_find_first(n, ".//termination"))})

answer<-data.frame(ids, terms)

答案 1 :(得分:0)

我设法从XPath in R: return NA if node is missing找到了解决方案

accounts <- data.frame(id=sapply(my_xml["//user//id"], xmlValue),
                       start=sapply(my_xml["//user//start"], xmlValue),
                       termination=sapply(xpathApply(my_xml, "//user",
                                                     function(x){
                                                     if("termination" %in% names(x))
                                                     xmlValue(x[["termination"]])
                                                     else NA}), function(x) x))