heatmap_包含分类值的数字矩阵

时间:2019-03-04 18:59:32

标签: r

我正在尝试从数据集中创建一个热图,但是在以数字矩阵进行导入和转换之后,似乎仍然有一些变量作为字符,因此未显示在热图中。

> data=as.matrix(Acc_Genes)
> str(data)
int [1:126, 1:24] 0 1 0 1 1 0 1 1 0 1 ...
 - attr(*, "dimnames")=List of 2
  ..$ : chr [1:126] "ISC01_ST11" "ISC02_ST11" "ISC03_ST11" "ISC08_ST11" ...
  ..$ : chr [1:24] "fimA" "fimB" "fimC" "fimD" ...
> is.numeric(data)

[1] TRUE
> heatmap(data)

> heatmap(data, scale="column")

热图:

heatmap

数据作为矩阵,列yfiN和allS作为字符?

data as matrix, columns yfiN and allS as characters?

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