Miniconda / Qiime2插件因多样性引起的错误:轴0:0的形状无效

时间:2019-03-04 13:30:03

标签: conda miniconda qiime

在Miniconda环境中使用QIIME2(2019.1)时遇到错误。我一直在用我自己的数据跟踪运动图像教程,并且一切正常,直到达到核心指标步骤为止。

qiime多样性核心指标-系统发生 –i系统发育root-tree.qza –i-table /用户/管理员/桌面/skin3/filtered_table.qza –p采样深度40000 –m-元数据文件sample-metadata.tsv –output-dir核心指标结果

来自多样性的插件错误:

轴0:0上的形状无效。

调试信息已保存到/var/folders/lh/ld9r0p7s3p357m6kcksvv4j00000gp/T/qiime2-q2cli-err-ds90x_md.log

我已经尝试过qiime fragment-insertion filter-features选项从表中清除树中不存在的序列,但是仍然遇到此错误。 什么意思?

问题似乎出在根树上,因为我可以使用table.qza计算香农的多样性,并检查元数据文件中的错误。

如何检查根目录树中的错误?无法再使用文本编辑器打开此.qza文件。 实际上,到目前为止,我的管道中只有一个样本/序列-这可能是错误吗?轴0确实在根目录树中还是导致问题的文件?

非常感谢您!

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