将vtkPoints转换为numpy数组?

时间:2011-03-31 08:40:22

标签: python numpy vtk

我在Python脚本中使用Mayavi2来计算3d等值面。结果我得到了一个vtkPoints对象。现在我想将这个vtkPoints对象(下面的代码示例中的'vtkout')转换为一个简单的numpy数组,其中3行包含所有x,y和z值。 我使用这样的代码获得vtkout:

import numpy
from enthought.mayavi import mlab
import array

randVol = numpy.random.rand(50,50,50)        # fill volume with some random potential
X, Y, Z = numpy.mgrid[0:50, 0:50, 0:50]      # grid
surf = mlab.contour3d(X, Y, Z, randVol, contours=[0.5])   # calc contour
vtkout = surf.contour.contour_filter.output.points        # get the vtkPoints object

目前我使用以下代码将点提取到数组中:

pointsArray = numpy.zeros((3, vtkout.number_of_points))
for n in range(vtkout.number_of_points):
    pointsArray[0,n] = vtkout[n][0]
    pointsArray[1,n] = vtkout[n][1]
    pointsArray[2,n] = vtkout[n][2]

我想知道是否没有一般程序可以方便,快捷和安全的方式为我做这样的转换?

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

正如对原始帖子的评论所证实,您可以尝试:

vtkout.to_array().T

这是一种不需要循环的直接方法。

答案 1 :(得分:2)

vtk_points.to_array()对我不起作用(to_array()似乎不存在于普通的vtk中。)

在我的案例中实际工作的是使用numpy_support模块:

from vtk.util import numpy_support
as_numpy = numpy_support.vtk_to_numpy(vtk_points.GetData())