我正在处理基本上是以下内容的循环
MyList = ['cttgaaat',attcggat',gtatcaag'...]
for value in text_file:
print(key_nucleotide_position)
key_nucleotide_position是文本文件中的给定数字, 返回这样的内容
In [1]: 1
3
5
7
...
我正在尝试一个看起来像这样的for循环
for value in MyList:
print(value[key_nucleotide_position])
print('\n')
但是,不是打印我想要的,而是
t
t
t
g
c
t
a
g
a
t
t
g
我只得到这个
t
t
g
当我在另一个for循环中放置一个for循环时,我设法使其正常工作,但这只是给了我这种格式的超长核苷酸序列(497行)
a
t
t
g
g
c
g
...
我知道如何分析,但不知道如何按照我希望的方式进行拆分,即每91个核苷酸-即使如此,返回值对于核苷酸的数量也没有意义我应该知道
任何帮助将不胜感激。
答案 0 :(得分:0)
最简单的帮助方法是提供完整的详细信息。我会推断这与学校有关,并尝试为您指明正确的方向。发布可复制的示例非常有帮助,以便某人可以轻松地重新创建设置并进行故障排除。如果文件较长,请尝试使用gists或pastebin之类的东西。
根据您的描述,我认为您有:
我认为您想获取n
序列的列表,遍历key_nucleotide_position
整数文件中的整数,并提取ith
的{{1}}元素?
让我们逐步了解您的工作,首先了解您如何遍历MyList
:
MyList
假设一个数字(例如MyList = ['cttgaaat', 'attcggat', 'gtatcaag']
for value in MyList:
print(value)
cttgaaat
attcggat
gtatcaag
)存储在变量3
中,则您需要在每个循环中执行此操作:
key_nucleotide_position
使用MyList = ['cttgaaat', 'attcggat', 'gtatcaag']
for value in MyList:
print(value[3])
中的第一个值,让我们看看它的作用:
MyList
您要根据整数切片从字符串中提取'cttgaaat'[3]
g
字符。
这个问题尚不完全清楚,但是我想您可能想扭转这一点,并从 list 中获得ith
项,而不是ith
字符在字符串中。
即考虑:
ith
现在,让您的MyList[1]
'attcggat'
循环循环,以便for
将MyList[foo]
更改为每个循环所需的内容。