Question

我正在尝试在装有Linux CentOS 7的笔记本电脑上安装Bioconductor oligo R软件包。无法通过通用的Bioconductor安装命令进行安装，因为它说已为Rnot注释安装了RCurl，并且需要重新安装。

我尝试通过以下命令安装它：install.packages("RCurl") 但不幸的是，它没有用。

这是日志：

Error: package or namespace load failed for ‘RCurl’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '/home/davide/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/RCurl/libs/RCurl.so':
  libiconv.so.2: cannot open shared object file: No such file or directory
Error: loading failed

Execution halted ERROR: loading failed
* removing ‘/home/davide/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/RCurl’

The downloaded source packages are in   ‘/tmp/RtmpAcmmPE/downloaded_packages’ Warning message: In install.packages("RCurl") :   installation of package ‘RCurl’ had non-zero exit status

关于如何使其工作的任何想法？

Answer 1

我能够通过安装miniconda并使用其R版本在R中安装RCurl和oligo软件包。

这就是我所做的：

我从他们的website下载了miniconda安装程序（我案子是64-bit (bash installer)）
我使文件可执行，然后执行了它。在Shell终端上，我运行了：
chmod 777 ./Downloads/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

./Downloads/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
我回答miniconda提示我的所有问题。
一旦安装了miniconda，我就运行R：R
然后我重新安装了RCurl：install.packages("RCurl");
然后我安装了oligo：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))

install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("oligo", version = "3.8")

这种方式对我来说一切正常。我希望它可以帮助其他人！

无法在Linux CentOS 7上安装R oligo和RCurl软件包

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