我有两个表（它们更大，有200,000行，这只是一个例子）
Table1:temptable
id |Chromosome | Start | End | Reference | Alternative | QUAL | MQ
........................................................................
NULL chr1 12334 12335 A TT 10 20
NULL chr1 12334 12335 C TT 5 3
NULL chr2 123 123 A T 1 2
NULL chr2 34 34 A T 11 60
NULL chr3 12 12 A T 6 NULL
Table2:TableVariants2
id | Chromosome | Start | End | Reference | Alternative
.............................................................
1 chr1 12334 12335 A TT
2 chr1 12334 12335 C TT
3 chr2 123 123 A T
4 chr2 34 34 A T
5 chr3 12 12 A T
我想基于相等的染色体，开始，结束，参考和替代来合并它们，并获得：
id |Chromosome | Start | End | Reference | Alternative | QUAL | MQ
........................................................................
1 chr1 12334 12335 A TT 10 20
2 chr1 12334 12335 C TT 5 3
3 chr2 123 123 A T 1 2
4 chr2 34 34 A T 11 60
5 chr3 12 12 A T 6 NULL
我尝试了以下方法，但是对于大表来说太慢了，我需要更快的方法
SELECT B.Maxid, A.Chromosome, A.Start, A.End, A.Reference, A.Alternative , A.QUAL,A.MQ
FROM temptable A
INNER JOIN ( SELECT `Chromosome`, `Start`, `End`, `Reference`,`Alternative`, MAX(id) AS Maxid FROM TableVariants2 GROUP BY `Chromosome`, `Start`, `End`, `Reference`,`Alternative`) B
ON A.Chromosome=B.Chromosome AND A.Start=B.Start AND A.End=B.End AND A.Reference=B.Reference AND A.Alternative=B.Alternative
INNER JOIN可以替代其他方法来加快查询速度吗？
答案 0 :(得分：2)
在编写查询时，您可以遵循以下几点：
"Create statistics table"让我们看看您是否可以执行以下步骤。 但是内部联接是基本联接，如果必须联接两个表，则无法替换。
答案 1 :(得分：0)
INDEX(Chromosome, Start, End, Reference, Alternative, id)-与GROUP BY相同的顺序。