Question

我有两个桌子

Table1:temptable3
id         |Chromosome | Start | End | Reference | Alternative | QUAL | MQ
........................................................................
NULL         chr1       12334  12335    A          TT            10   20
NULL         chr1       12334  12335    C          TT            5    3
NULL         chr2       123    123      A           T            1    2
NULL         chr2       34     34       A           T            11   60
NULL         chr3       12     12       A           T            6    NULL

Table2:TableVariants2
id          | Chromosome | Start | End | Reference | Alternative 
.............................................................
1            chr1          12334  12335   A        TT
2            chr1          12334  12335   C        TT
3            chr2          123    123     A         T
4            chr2          34     34      A         T
5            chr3          12     12      A         T

我想基于相等的染色体，开始，结束，参考和替代来合并它们，并获得：

id         |Chromosome | Start | End | Reference | Alternative | QUAL | MQ
........................................................................
1           chr1       12334  12335     A             TT         10     20
2           chr1       12334  12335     C             TT         5      3
3           chr2       123    123       A              T         1      2
4           chr2       34     34        A              T         11     60
5           chr3       12     12        A              T         6     NULL

我尝试了以下操作，但这是一个永无止境的查询...

UPDATE temptable3
INNER JOIN TableVariants2
ON temptable3.Chromosome = TableVariants2.Chromosome 
  AND temptable3.Start = TableVariants2.Start 
  AND temptable3.End = TableVariants2.End 
  AND temptable3.Reference = TableVariants2.Reference 
  AND temptable3.Alternative = TableVariants2.Alternative
SET temptable3.id = TableVariants2.id;

Answer 1

您需要将两个表的所有列组合在一起，形成一个唯一的ID，必须在连接中使用此类列并选择所需的列，希望对您有所帮助。

    SELECT B.id, A.Chromosome,A.Start,A.End,A.Reference,A.Alternative,A.QUAL,A.MQ
    FROM temptable3 A
    INNER JOIN TableVariants2 B
    ON A.CHROMOSOME=B.CHROMOSOME AND A.START=B.STAR AND A.END=B.END
    AND A.REFERENCE=B.REFERENCE AND A.ALTERNATE=B.ALTERNATE

MYSQL：根据多个条件合并两个具有不同列数的表，这些表不共享ID

1 个答案: