通过连续变量在ggplot中彩色面

时间:2019-02-25 20:32:14

标签: r ggplot2 data-visualization background-color facet-wrap

**使用可重复数据编辑**

我有一个data.frame,其中包含50种实验性治疗随时间的增长曲线。我将它们绘制为多面5x10图网格。考虑到我的实验治疗方法,我还以合理的方式订购了它们。

我运行了回归函数以查找每种处理的增长率,并将斜率值保存在另一个数据框中。我已经绘制了数据,回归线和增长率值,但是我想根据该回归斜率值为各个多面图的背景着色,但是我不知道如何设置颜色以调用一个连续变量,尤其是来自不同df且行数不同的连续变量(原始df有300行,我要调用的df有50行-每种处理一个)。

我的代码如下:

Df:

df <- data.frame(matrix(ncol = 3,nrow=300))
colnames(df) <- c("Trt", "Day", "Size")
df$Trt <- rep(1:50, each=6)
df$Day <- rep_len(1:6, length.out=300)
df$Size <- rep_len(c(3,5,8,9,12,12,3,7,10,16,17,20),length.out = 300)

回归函数和输出数据框:

regression=function(df){
  reg_fun<-lm(formula=df$Size~df$Day) 
  slope<-round(coef(reg_fun)[2],3) 
  intercept<-round(coef(reg_fun)[1],3) 
  R2<-round(as.numeric(summary(reg_fun)[8]),3)
  R2.Adj<-round(as.numeric(summary(reg_fun)[9]),3)
  c(slope,intercept,R2,R2.Adj)
}
library(plyr)
slopevalues<-ddply(df,"Trt",regression)
colnames(slopevalues)<-c ("Trt","slope","intercept","R2","R2.Adj")

图:

ggplot(data=df, aes(x=Day, y=Size))+
geom_line() +
geom_point() +
xlab("Day") + ylab("Size (μm)")+
geom_smooth(method="lm",size=.5,se=FALSE)+ 
geom_text(data=slopevalues,
            inherit.aes=FALSE, 
            aes(x =1, y = 16,hjust=0,
            label=paste(slope)))+ 
facet_wrap(~ Trt, nrow=5)

我要做的是根据渐变上的斜率值(slopevalues $ slope)为各个图表的背景着色。我的真实数据不只是重复的2个值,所以我想根据该值在渐变的颜色上进行此操作。

欢迎任何建议。

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1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您可以将geom_rect与无限坐标结合使用:

ggplot(data=df, aes(x=Day, y=Size))+
  ## This is the only new bit
  geom_rect(
    aes(fill = slope, xmin = -Inf, xmax = Inf, ymin = -Inf, ymax = Inf), 
    slopevalues,
    inherit.aes = FALSE
  ) +
  ## New bit ends here
  geom_line() +
  geom_point() +
  xlab("Day") + ylab("Size (μm)")+
  geom_smooth(method="lm",size=.5,se=FALSE)+ 
  geom_text(data=slopevalues,
            inherit.aes=FALSE, 
            aes(x =1, y = 16,hjust=0,
                label=paste(slope)))+ 
  facet_wrap(~ Trt, nrow=5)

enter image description here