我有一个数据框,其中对于每个分组变量,有两种类型的变量:一组变量,我需要每组中的均值,另一组变量,我需要每组中的总和。也就是说,我想在应用某些链函数(例如filter和select之后,将两个不同的汇总函数应用于数据帧中的两个不同的变量集,因为原始问题比这更复杂)。
> head(df, 10)
group.var x1 x2 x3 y1 y2 y3
1 1 460 477 236 65 142 384
2 1 88 336 114 93 378 52
3 1 93 290 353 384 498 43
4 1 394 105 306 172 216 267
5 1 402 145 423 425 125 322
6 2 187 473 466 279 81 484
7 2 465 373 50 422 136 78
8 2 404 455 362 205 315 12
9 2 54 202 242 348 324 275
10 2 340 380 14 442 376 491
理想情况下,我想在同一链中两次使用dplyr
的{{1}}函数在两个不同的操作中将summarize_at
应用于变量集1和mean
应用于变量2 ,但是出于明显的原因,返回的分组df无法识别第二组变量。
sum
我可以编写两个片段,它们使用> df1 <- df %>%
+ select(group.var, x1:xn, y1:yn) %>% # just for reference
+ filter(x2 != 20) %>% # just for reference
+ group_by(group.var) %>%
+ summarize_at(vars(x1:xn), mean) %>%
+ summarize_at(vars(y1:ym), sum)
Error in is_character(x, encoding = encoding, n = 1L) :
object 'y1' not found
函数进行相同的分组,选择和过滤,但汇总不同,然后使用summarize_all
加入分组的df,但是我正在寻找一个更有效的方法。
我想要的最终结果是:
group.var
任何建议,最好使用 group.var x1 x2 x3 y1 y2 y3
1 1 287.4 270.6 286.4 1139 1359 1068
2 2 290.0 376.6 226.8 1696 1232 1340
或dplyr
?
答案 0 :(得分:0)
一种方法是先使用mutate
,然后使用distinct
:
df %>%
select(group.var, x1:x3, y1:y3) %>%
filter(x2 != 20) %>%
group_by(group.var) %>%
mutate_at(vars(x1:x3), mean) %>%
mutate_at(vars(y1:y3), sum) %>%
distinct()
输出:
# A tibble: 2 x 7
# Groups: group.var [2]
group.var x1 x2 x3 y1 y2 y3
<int> <dbl> <dbl> <dbl> <int> <int> <int>
1 1 287. 271. 286. 1139 1359 1068
2 2 290 377. 227. 1696 1232 1340
另一种方法是对全部进行汇总,然后仅选择相关的组合(mean
为x
,sum
为y
):
df %>%
select(group.var, x1:x3, y1:y3) %>%
filter(x2 != 20) %>%
group_by(group.var) %>%
summarise_all(funs(mean, sum)) %>%
select(group.var, matches("x\\d_mean"), matches("y\\d_sum"))
输出:
# A tibble: 2 x 7
group.var x1_mean x2_mean x3_mean y1_sum y2_sum y3_sum
<int> <dbl> <dbl> <dbl> <int> <int> <int>
1 1 287. 271. 286. 1139 1359 1068
2 2 290 377. 227. 1696 1232 1340
如果您对名称摘要的指定感到不便,可以在末尾添加%>% rename_all(function(x) gsub("_.*", "", x))
之类的内容。
最后但并非最不重要的一点是,使用purrr
的方法(在此将提供与第一种方法相同的输出):
library(tidyverse)
list(c(paste0("x", 1:3)), c(paste0("y", 1:3))) %>%
map2(lst(mean, sum),
~ df %>%
select(group.var, x1:x3, y1:y3) %>%
filter(x2 != 20) %>%
group_by(group.var) %>%
summarise_at(.x, .y)
) %>%
reduce(inner_join)
请注意,上面的示例中的小数点消失了,因为tibble
是这样显示的,它们仍然存在,您可以在控制台中通过在每个代码段的末尾添加%>% as.data.frame()
来显示它们。
答案 1 :(得分:0)
借助 dplyr 的新 across
功能,它可以通过这种方式实现
df1 <- df %>%
dplyr::select(group.var, x1:x3, y1:y3) %>% # just for reference
filter(x2 != 20) %>% # just for reference
group_by(group.var) %>%
summarise(across(x1:x3, mean), across(y1:y3, sum))