我正在使用一个名为ete3的python软件包,在此过程中,我需要使用以下命令来下载庞大的数据库:
from ete3 import NCBITaxa
ncbi = NCBITaxa()
ncbi.update_taxonomy_database()
但是我不知道如何指定所有下载文件的存放路径?默认情况下,它们放置在内存不足的地方。
有人有主意吗?
这是包含软件包所有信息的页面: http://etetoolkit.org/docs/latest/tutorial/tutorial_ncbitaxonomy.html#id1
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根据您提供的文档,似乎所有下载的文件都存储在您的主目录~/.etetoolkit/taxa.sqlite
中。它可能是隐藏的,因为它是一个配置文件,但是您可以在终端上自由访问它,或者将文件资源管理器UI设置为显示隐藏的文件。