我致力于使用医学图像进行深度学习,并使用nibabel软件包读取python中的.nii文件。我的代码如下所示。
import numpy as np
from pylab import *
import nibabel as nib
img_path=r"C:\\Users\\Umit Kilic\\Komodomyfiles\\umit\\myfile.nii"
nii_obj=nib.load(img_path)
img=nii_obj.get_fdata()
slice1=(img[60,:,:])
slice2=(img[:,80,:])
slice3=(img[:,:,60])
然后,我选择一个切片并希望在图中看到。
figure()
imshow(slice2)
show()
在那之后,我想应用一些操作,例如:
slice2[:, :, 0] -= 123.68
slice2[:, :, 1] -= 116.779
slice2[:, :, 2] -= 103.939
但是我不能。原因是我运行该代码的原因:
print(slice2.shape)
输出为
通常,应该有第三个参数说明通道数。有两个参数。那么,我的slice2是灰度还是RGB?如何应用上面提到的操作?