我想将RMarkdown中的Python代码块导出到外部文件。 knitr:purl()实现了此目的,但我只能使其在R代码块上起作用。它不适用于R以外的任何其他语言吗?
例如,从下面将python代码导出到my_script.py文件中。
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title: "Untitled"
output: html_document
---
## Header
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```{python}
x = 10
y = 20
z = x + y
print(z)
```
答案 0 :(得分:1)
当前purl
输出已注释掉的非R代码。因此,我们需要重新定义输出函数以覆盖它。
这是一个简单的脚本,其中(1)仅输出python代码,并且(2)剥离文档(我从knitr源中获取了该函数并对其进行了破解):
library("knitr")
# New processing functions
process_tangle <- function (x) {
UseMethod("process_tangle", x)
}
process_tangle.block <- function (x) {
params = opts_chunk$merge(x$params)
# Suppress any code but python
if (params$engine != 'python') {
params$purl <- FALSE
}
if (isFALSE(params$purl))
return("")
label = params$label
ev = params$eval
code = if (!isFALSE(ev) && !is.null(params$child)) {
cmds = lapply(sc_split(params$child), knit_child)
one_string(unlist(cmds))
}
else knit_code$get(label)
if (!isFALSE(ev) && length(code) && any(grepl("read_chunk\\(.+\\)",
code))) {
eval(parse_only(unlist(stringr::str_extract_all(code,
"read_chunk\\(([^)]+)\\)"))))
}
code = knitr:::parse_chunk(code)
if (isFALSE(ev))
code = knitr:::comment_out(code, params$comment, newline = FALSE)
# Output only the code, no documentation
return(knitr:::one_string(code))
}
# Reassign functions
assignInNamespace("process_tangle.block",
process_tangle.block,
ns="knitr")
# Purl
purl("tmp.Rmd", output="tmp.py")
这是我的tmp.Rmd
文件。请注意,它有一个R块,我不想在结果中出现:
---
title: "Untitled"
output: html_document
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## Header
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod
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```{python}
#!/usr/bin/env python
# A python script
```
```{python}
x = 10
y = 20
z = x + y
print(z)
```
```{r}
y=5
y
```
运行Rscript extract.R
我得到tmp.py
:
#!/usr/bin/env python
# A python script
x = 10
y = 20
z = x + y
print(z)
PS我发现此问题正在寻找相同问题的解决方案。由于没有人回答,我开发了自己的解决方案:)