ITK Elastix在3D图像配准中从zstack切除部分图像

Question

我是ITK和Elastix的新手，在斑马鱼zstack上执行3D图像配准时遇到问题。我的图像是16位低对比度灰度，并且是9424x2048像素。我将Elastix设置为进行刚性转换，将运动图像与固定图像对齐，但是在平移后，运动图像被截断了，我不确定为什么。 zstack有29个级别，下面我显示z =10。如果我错了，请纠正我，但我相信，由于旋转，鱼尾巴的z切片的强度看起来有所不同。

我想知道为什么图像被剪切掉了，我可以尝试修复它。谢谢！