熊猫read_csv():如果不匹配架构则删除行

时间:2019-02-16 16:09:13

标签: python pandas csv dataframe data-cleaning

我有一个csv文件,需要将其读取并解析为Pandas数据框。 从理论上讲,所有列均应遵循已知的数字数据和字符串模式。 我知道有些记录被破坏了,字段数较少或顺序错误。

我想做的是摆脱所有这些有问题的行。

作为参考,我以前在PySpark上使用'DROPMALFORMED'来筛选出与架构不匹配的记录。

dataSchema = StructType([ 
    StructField("col1", LongType(), True), 
    StructField("col2", StringType(), True)])

dataFrame = sqlContext.read \
    .format('com.databricks.spark.csv') \
    .options(header='false', delimiter='\t', mode='DROPMALFORMED') \
    .load(filename, schema = dataSchema) 

对于Pandas,我找不到简单的方法。 例如,我认为此代码片段可以解决问题,但它只是复制回错误的值,而不是删除它。

dataFrame['col1'] = dataFrame['col1'].astype(np.int64, errors='ignore')

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

可能pandas.to_numeric会有所帮助。它具有errors='coerce'选项,该选项将所有错误的值替换为NaN。然后,您可以使用dropna()函数删除包含NaN的行:

import pandas as pd
df=pd.DataFrame([[1,2,3],[4,5,6],[7,'F',8]],columns=['col1','col2','col3'])
df['col2']=pd.to_numeric(df['col2'],errors='coerce')
df.dropna(inplace=True)