rpy2错误在给定目录的情况下加载了特定的软件包

时间:2019-02-14 19:53:01

标签: python r python-3.x rpy2

我已经使用rpy2在python中成功调用了R包。但是,我今天才在R中安装了Elasticnet,并检查了是否可以在R中加载该库而没有问题,而且包名文件夹 elasticnet 也位于我的目录中。

我想使用importr与其他软件包进行相同的调用,但是它始终显示错误消息:

  

loadNamepace(name)中的错误:没有名为“ elasticnet”的软件包。

但是我已经去那个地址并实际看到了该软件包,在R中我也看到该软件包已安装。有人知道如何解决这个问题吗?

这就是我在python中调用其他程序包的方式,例如pls程序包:

import rpy2
import rpy2.robjects as ro
from rpy2.robjects.packages import importr

utils = importr("utils")
d = {'print.me': 'print_dot_me', 'print_me': 'print_uscore_me'}

pls = importr('pls', robject_translations = d, lib_loc = "/Users/Viii/Anaconda3/envs/rstudio/lib/R/library")

但是当我将其替换为elasticnet时,它将无法正常工作。

它给了我错误信息

  

“ RRuntimeWarning:'package'lars'由具有以下版本的R版本安装   内部结构不同;它需要重新安装才能与此R一起使用   版本”。

我也尝试安装glmnet,它还会给我错误消息

en = importr('glmnet', robject_translations = d, lib_loc = "/Users/Viii/Anaconda3/envs/rstudio/lib/R/library")
  

回溯(最近通话最近一次):

     

文件,第1行,位于en =   importr('glmnet',robject_translations = d,lib_loc =   “ / Users / Viii / Anaconda3 / envs / rstudio / lib / R / library”)

     

文件   “ C:\ Users \ Viii \ Anaconda3 \ lib \ site-packages \ rpy2-2.9.4-py3.6-win-amd64.egg \ rpy2 \ robjects \ packages.py”,   导入程序中的第453行env = _get_namespace(rname)

     

RRuntimeError:loadNamespace(name)中的错误:没有包   叫做“ glmnet”

R中的sessioninfo:

R version 3.5.0 (2018-04-23)
Platform: x86_64-conda_cos6-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 16.04.5 LTS

Matrix products: default
BLAS/LAPACK: /home/viii/anaconda3/envs/rstudio/lib/R lib/libRblas.so

locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
[9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods [7] base     

other attached packages:
[1] elasticnet_1.1.1 lars_1.2        

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.5.0 tools_3.5.0    yaml_2.1.18   

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