NetworkX双向颜色混合顺序

时间:2019-02-14 15:00:19

标签: python networkx bipartite

我使用NetworkX创建了一个二部图,并希望分别为这两组着色。我使用networkX bipartite模块中的color()函数。但是,颜色dict中的节点顺序与B.nodes中的顺序不同,例如:

B.nodes = ['a', 1, 2, 3, 4, 'c', 'b']

bipartite.color(B)= {'a': 1, 1: 0, 2: 0, 'b': 1, 4: 0, 'c': 1, 3: 0}

这将导致图形的颜色错误地显示如下:

incorrectly colour graph

代码如下:

B = nx.Graph()
B.add_nodes_from([1,2,3,4], bipartite=0) # Add the node attribute "bipartite"
B.add_nodes_from(['a','b','c'], bipartite=1)
B.add_edges_from([(1,'a'), (1,'b'), (2,'b'), (2,'c'), (3,'c'), (4,'a')])
bottom_nodes, top_nodes = bipartite.sets(B)

color = bipartite.color(B)
color_list = []

for c in color.values():
    if c == 0:
        color_list.append('b')
    else:
        color_list.append('r')

# Draw bipartite graph
pos = dict()
color = []
pos.update( (n, (1, i)) for i, n in enumerate(bottom_nodes) ) # put nodes from X at x=1
pos.update( (n, (2, i)) for i, n in enumerate(top_nodes) ) # put nodes from Y at x=2

nx.draw(B, pos=pos, with_labels=True, node_color = color_list)
plt.show()

有什么我想念的吗?

谢谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

绘制图形时,您的color_list和节点列表(B.nodes)的顺序不同。

color_list
['r', 'b', 'b', 'r', 'b', 'r', 'r']

B.nodes
NodeView((1, 2, 3, 4, 'a', 'b', 'c'))

我用字典中的B.nodes顺序创建了一个color_list,并从B中的nodelist映射了二部集。

B = nx.Graph()
B.add_nodes_from([1,2,3,4], bipartite=0) # Add the node attribute "bipartite"
B.add_nodes_from(['a','b','c'], bipartite=1)
B.add_edges_from([(1,'a'), (1,'b'), (2,'b'), (2,'c'), (3,'c'), (4,'a')])
bottom_nodes, top_nodes = bipartite.sets(B)

color = bipartite.color(B)

color_dict = {0:'b',1:'r'}

color_list = [color_dict[i[1]] for i in B.nodes.data('bipartite')]

# Draw bipartite graph
pos = dict()
color = []
pos.update( (n, (1, i)) for i, n in enumerate(bottom_nodes) ) # put nodes from X at x=1
pos.update( (n, (2, i)) for i, n in enumerate(top_nodes) ) # put nodes from Y at x=2

nx.draw(B, pos=pos, with_labels=True, node_color = color_list)
plt.show()

输出:

enter image description here