我有这样的数据:-
|--------|---------|
| Col1 | Col2 |
|--------|---------|
| X | a,b,c |
|--------|---------|
| Y | a,b |
|--------|---------|
| X | b,d |
|--------|---------|
我想将这些分类数据转换为虚拟变量。由于我的数据很大,如果我使用的是熊猫的get_dummies()
,它会给内存带来错误。我想要这样的结果:-
|------|------|------|------|------|------|
|Col_X |Col_Y |Col2_a|Col2_b|Col2_c|Col2_d|
|------|------|------|------|------|------|
| 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 |
|------|------|------|------|------|------|
| 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 |
|------|------|------|------|------|------|
| 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 |
|------|------|------|------|------|------|
我曾尝试使用this转换Col2,但是由于数据量大而导致出现MemoryError,并且col2中也存在很多可变性。
所以
1)如何将多个分类列转换为虚拟变量?
2)熊猫get_dummy()正在给出内存错误,那么我该如何处理呢?
答案 0 :(得分:1)
对于您遇到内存问题,我几乎是肯定的,因为str.get_dummies返回的数据类型为np.int64
的数组由1和0组成。这与pd.get_dummies的行为完全不同,后者的行为是返回数据类型为uint8
的值的数组。
这似乎是known issue。但是,过去一年没有更新,也没有修复。检出source code中的str.get_dummies确实会确认它正在返回np.int64
。
一个8位整数将占用1个字节的内存,而一个64位整数将占用8个字节。我希望通过找到一种单编码Col2
的替代方法来避免内存问题,该方法可以确保输出都是8位整数。
这是我的方法,从您的示例开始:
df = pd.DataFrame({'Col1': ['X', 'Y', 'X'],
'Col2': ['a,b,c', 'a,b', 'b,d']})
df
Col1 Col2
0 X a,b,c
1 Y a,b
2 X b,d
Col1
包含简单的,非定界的字符串,因此我们可以轻松地使用pd.get_dummies对它进行一次热编码:df = pd.get_dummies(df, columns=['Col1'])
df
Col2 Col1_X Col1_Y
0 a,b,c 1 0
1 a,b 0 1
2 b,d 1 0
到目前为止很好。
df['Col1_X'].values.dtype
dtype('uint8')
Col2
中用逗号分隔的字符串中包含的所有唯一子字符串的列表:vals = list(df['Col2'].str.split(',').values)
vals = [i for l in vals for i in l]
vals = list(set(vals))
vals.sort()
vals
['a', 'b', 'c', 'd']
str.contains
为每个值创建一个新列,例如'a'
。如果新行中的每一行在'a'
的字符串中实际上具有新列的值,例如Col2
,则该行将包含1。创建每个新列时,请确保将其数据类型转换为uint8
:col='Col2'
for v in vals:
n = col + '_' + v
df[n] = df[col].str.contains(v)
df[n] = df[n].astype('uint8')
df.drop(col, axis=1, inplace=True)
df
Col1_X Col1_Y Col2_a Col2_b Col2_c Col2_d
0 1 0 1 1 1 0
1 0 1 1 1 0 0
2 1 0 0 1 0 1
这将导致数据框符合您所需的格式。值得庆幸的是,从Col2
开始进行一键编码的四个新列中的整数每个仅占用1个字节,而不是每个8个字节。
df['Col2_a'].dtype
dtype('uint8')
如果在偶然的情况下,上述方法不起作用。我的建议是使用str.get_dummies对行块中的Col2
进行一次热编码。每次执行块时,都将其数据类型从np.int64
转换为uint8
,然后转换为transform the chunk to a sparse matrix。您最终可以将所有块连接在一起。
答案 1 :(得分:1)
我也想提供我的解决方案。我还要感谢@ James-dellinger的回答。所以这是我的方法
df = pd.DataFrame({'Col1': ['X', 'Y', 'X'],
'Col2': ['a,b,c', 'a,b', 'b,d']})
df
Col1 Col2
0 X a,b,c
1 Y a,b
2 X b,d
我首先拆分Col2值并将其转换为列值。
df= pd.DataFrame(df['Col2'].str.split(',',3).tolist(),columns = ['Col1','Col2','Col3'])
df
Col1 Col2 Col3
0 a b c
1 a b None
2 b d None
然后我在不提供任何前缀的情况下对此数据帧应用了虚拟创建。
df=pd.get_dummies(df, prefix="")
df
_a _b _b _d _c
0 1 0 1 0 1
1 1 0 1 0 0
2 0 1 0 1 0
现在要获得所需的结果,我们可以汇总所有重复的列。
df.groupby(level=0, axis=1).sum()
df
_a _b _c _d
0 1 1 1 0
1 1 1 0 0
2 0 1 0 1
对于Col1,我们可以使用pd.get_dummies()
直接创建伪变量,并将其存储到假设为col1_df
的其他数据框中。我们可以使用pd.concat([df,col1_df], axis=1, sort=False)