错误：软件包“ digest”是由内部版本不同的R版本安装的；需要重新安装该版本R才能使用此版本

Question

我将闪亮的应用程序托管在还安装了RStudio服务器的Ubuntu 16.04服务器上。可以使用localhost:3838上的演示应用程序成功访问闪亮服务器的欢迎页面。但是，当我尝试运行一个简单的应用程序（默认的闪亮的老忠实间歇泉数据）：localhost:3838/test时，我得到了An error has occurred The application failed to start。应用程序在初始化期间退出。

这是在我从R.3.4升级到3.5.2之后出现的

我已经取出了一个应用程序日志，上面写着："Error: package ‘digest’ was installed by an R version with different internals; it needs to be reinstalled for use with this R version Execution halted"。我采取了以下步骤，但仍然是相同的错误：

1. 完全从目录路径中卸载摘要包，然后重新安装。
2. 卸载rjava软件包并重新安装
3. 删除整个闪亮的服务器并重新安装

shiny-server.log：

[2019-02-13T12:03:33.048] [INFO] shiny-server - Starting listener on http://[::]:3838
[2019-02-13T12:14:20.757] [INFO] shiny-server - Error getting worker: Error: The application exited during initialization.
[2019-02-13T12:24:50.935] [INFO] shiny-server - Error getting worker: Error: The application exited during initialization.
[2019-02-13T12:25:32.009] [INFO] shiny-server - Error getting worker: Error: The application exited during initialization.
[2019-02-13T12:26:14.637] [INFO] shiny-server - Error getting worker: Error: The application exited during initialization.
[2019-02-13T12:30:02.063] [INFO] shiny-server - Error getting worker: Error: The application exited during initialization.
[2019-02-13T13:22:45.655] [INFO] shiny-server - Error getting worker: Error: The application exited during initialization.

shiny-application.log：

Error: package ‘digest’ was installed by an R version with different internals; it needs to be reinstalled for use with this R version
Execution halted

没有软件包失败或无法加载，但是闪亮的应用程序无法正常工作，并给出了错误。预期的输出是闪亮服务器上正在运行的应用程序

有任何帮助吗？

Answer 1

在R中运行此代码（在Ubuntu中使用sudo R命令）对我有用：

update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)

来自RStudio论坛here。