有存储协议缓冲区的好习惯吗？

Question

• 我目前有一个XML文件，其中描述了所有系统组件。
• 然后用脚本将XML中的所有组件放入Neo4j数据库中。
• 我的各种应用程序都通过API查询此数据库。

问题：

• neo4j解决方案非常慢；我应该改用协议缓冲区吗？
• 数据将存储在哪里？
• 处理协议缓冲区的数据库是否有通用的“最佳实践”？