如何在循环中使用参数范围来运行同一命令？

Question

我想在--CHROM标志后使用1到22之间的值来运行此命令，例如：

python eigenMT.py --CHROM 1  --QTL SG.cis.eqtls.txt --GEN SG.genotypes.txt --GENPOS SG.gen.positions.txt --PHEPOS SG.phe.positions.txt --OUT SG_Out.txt

我试图制作一个bash脚本，如下所示：

for i in {1..22}
do
        python eigenMT.py --CHROM $i  --QTL SG.cis.eqtls.txt --GEN SG.genotypes.txt --GENPOS SG.gen.positions.txt --PHEPOS SG.phe.positions.txt --OUT SG_Out.txt
done

但是我得到一个空的SG_Out.txt文件。

您能帮我如何在所有22个值上运行并将输出写到一个文件中吗？

我应该提到，如果我一个接一个地运行（无循环），它将起作用。

Answer 1

这可能可以完成您想要的操作，而无需创建临时文件

for i in {1..22}
do
        python eigenMT.py --CHROM $i  --QTL SG.cis.eqtls.txt --GEN SG.genotypes.txt --GENPOS SG.gen.positions.txt --PHEPOS SG.phe.positions.txt | tail -n +2
done > SG_Out.txt