Question

我在名为“变体”的集合中有这样的文档：

{
    "_id" : "An_FM000900_Var_10_100042505_100042505_G_A",
    "analysisId" : "FM000900",
    "chromosome" : 10,
    "start" : 100042505,
    "end" : 100042505,
    "size" : 1,
    "reference" : "G",
    "alternative" : "A",
    "effects" : [ 
        {
            "_id" : "Analysis:FM000900-Variant:An_FM000900_Var_10_100042505_100042505_G_A-Effect:0",

            "biotype" : "protein_coding",
            "impact" : "LOW",
        },
        {
            "_id" : "Analysis:FM000900-Variant:An_FM000900_Var_10_100042505_100042505_G_A-Effect:1",

            "biotype" : "protein_coding",
            "impact" : "MODERATE",
        }
    ]
}

我想在该集合中找到符合某些条件（“ analysisId”：“ FM000900”）的文档，然后我要在“效果”数组字段上投影以仅在“效果”数组中引入第一个元素符合某些标准（“生物型”：“蛋白质编码”和“影响”：“中等”）。

问题是，仅当“效果”数组中的至少一个元素满足条件时，我才想显示主要的“变体”文档。

通过以下查询，我得到了预期的结果，除了我得到的“变量”文档的“效果”数组字段为空。

db.getCollection('variants').find(  
{
     "analysisId":"FM000900"
}
,
{ 
    "effects":{
        "$elemMatch" : {
            "biotype" : "protein_coding",
            "impact" : "MODERATE"
        }
    }
}     
).skip(0).limit(200)

如果可能的话，有人可以将查询转换为仅在投影后的“效果”数组中包含某些元素的“变体”文档吗？

是否可以通过其他方式完成，如果可能的话，不使用聚合框架？因为该馆藏有数百万份文档，因此必须具有高性能。

非常感谢大家！

Answer 1

除投影外，仅使用$elemMatch as query operator，它将过滤至少具有一个符合所有条件的effect数组元素的变量。因此，您的查询将是：

db.getCollection('variants').find(  
{
     "analysisId":"FM000900",
     "effects":{
        "$elemMatch" : {
            "biotype" : "protein_coding",
            "impact" : "MODERATE"
        }
    }
}
,
{ 
    "effects":{
        "$elemMatch" : {
            "biotype" : "protein_coding",
            "impact" : "MODERATE"
        }
    }
}     
).skip(0).limit(200)

此外，同时涵盖查询和投影的compound multikey index可以提高阅读性能，但请谨慎使用，因为它会大大降低书写性能。

mongodb-是否可以在查找查询中的$ elemMatch投影之后进行过滤？

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