GEE的R代码花费的时间太长或无法正常工作

时间:2019-02-04 05:00:20

标签: r longitudinal gee

我正在尝试使用R运行多元序数GEE模型。因为我正在使用序数数据(依次为1、2、3),所以我考虑使用两个包:1)geepack中的'ordgee'和2)来自multgee的“ ordLORgee”。我的结果也与之相关,所以我使用了logit链接。

我的数据集包括40,000多个纵向观测值。如果我使用较小的数据集(即500、1000),则来自multgee和geepack的代码可以工作,但是当我尝试使用完整的数据集运行这些功能时,需要3个多小时才能收到一条错误消息,指出我的R连接是迷路了。

我想试着从multgee中找到

ordLORgee(output ~ day + pre2 + pre3 + pre4, id = person, link = 'logit', data = sampledf)

我想通过geepack适应:

ordgee(ordered(output) ~ day + pre2 + pre3 + pre4, id = person, data = final)

谁能告诉我这个问题的来源?理想情况下,我想使用multgee软件包,因为该软件包/ GEE方法相对较新,我无法从在线获得太多帮助。谢谢。

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