如何在R中创建和弦交集图?

时间:2019-02-01 22:50:33

标签: r intersection chord-diagram

在R中,我想使用弦图可视化许多集合之间的一对一相交。

here很好地说明了我的想法。为了清楚起见,让我复制插图中的示例。假设有三组(例如,人格特征),每组都有一些观察结果(例如,姓名)。这些观察中的一些在所有三个集合中,一些在两个集合中,而某些仅在一个集合中。仅使用三组,维恩图也可以用于可视化相交,但是在具有许多组的情况下,“弦相交图”可能有助于可视化所有相交。

在R中,circlize包可用于创建和弦图。但是,在关于该包的book中,我找不到有关如何创建和弦相交图的指针。

重要的是,还有其他方法可以可视化R中的许多单向路口(例如UpSetR),但是这些方式在可以显示的路口数量上受到限制,我希望和弦图的限制性较小。

是否有可能使用circlize封装在这样一种方式,它返回一个弦相交图?如果没有,还有其他R(最好是)软件包可以完成这项工作吗?

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