如何将cut命令结果保存到文件中

Question

我的问题很简单：

我用过：

for file in `/path/*_aa.fasta.aln; do cut -f 1 -d "|" ${file} > ${file}.1; done`

在这里，你可以看到我的结果存储在${file}.1，但如何做中庸之道它${file}直接？

Answer 1

尝试一下：

for file in "/path/*_aa.fasta.aln";
do 
    cut -f 1 -d "|" ${file} > ${file}.tmp; 
    mv  ${file}.tmp ${file}; 
done

Answer 2

由于无法同时读写文件，因此需要保存/缓冲输出，然后将输出（输出）保存到文件中。

例如这样的示例（此操作仅删除/添加一个尾随的空换行符）：

cmd file | { buf=$(cat); printf "%s\n" "$buf" } > file

或：

temp=$(mktemp)
cmd file > "$temp"
mv "$temp" file

或者如果您有sponge可以做到这一点：

cmd file | sponge file

因此您可以：

for file in /path/*_aa.fasta.aln; do 
    cut -f 1 -d "|" ${file} > ${file}.1
    mv ${file}.1 ${file}
done

或者如果您有sponge：

for file in /path/*_aa.fasta.aln; do 
    cut -f 1 -d "|" "${file}" | sponge "${file}"
done

请注意：不要使用反引号``。使用命令替换$( ... )。反引号已弃用，不可读，并且在嵌套时变得更加不可读。