dge列表给出了抄本ID值的NA计数错误

时间:2019-01-31 00:32:38

标签: r

我对R很陌生,正在分析RNA序列数据。这是我的数据框的格式

transcript_id C1 C2 C3 B4 B5 B6 E4 E5 E6 
ENSG00000000003 2019 1619 1597 1343 1026 1010 871 1164 1115 
ENSG00000000005 1 2 1 1 1 2 0 0 0 
ENSG00000000419 1936 1469 1769 2604 2244 2132 2301 2332 2184 
ENSG00000000457 790 826 858 693 561 489 456 615 533 
ENSG00000000460 320 372 362 368 285 282 254 342 265

使用命令时

data <- DGEList(counts) 

我收到错误

  

错误:不适用NA计数。

我意识到这是因为transcript_id列,因为当我删除它时,它可以正常工作。有什么建议么?谢谢

data <- DGEList(counts)

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