我想最小化对数可能性,以尽可能接近早期计算出的分布。我的分布是Beta-Binomial分布,我需要选择 a(lpha)和 b(eta)参数。我的函数基于另一个topic的答案之一来计算负对数似然。
def nll(a, b):
k = players['Goals'].sum() # equal to the number of successes
n = players['Shots'].sum() # equal to the number of trials
log = gammaln(n + 1) + gammaln(k + a) + gammaln(n - k + b) + gammaln(a + b) - (gammaln(k + 1) + gammaln(n - k + 1) + gammaln(a) + gammaln(b) + gammaln(n + a + b))
return -(np.exp(log))
接下来,我想最小化对数可能性。在R中,可以使用以下脚本完成此操作:
# maximum likelihood estimation
m <- mle(ll, start = list(alpha = 1, beta = 10),
method = "L-BFGS-B", lower = c(0.0001, 0.1))
ab <- coef(m)
我试图按如下方式在Python中重现R脚本:
init_params = [1, 10] # This is equal to the start-argument in R
res = minimize(nll, x0=init_params, method='L-BFGS-B', options={'disp' : True, 'maxiter': 250})
运行此命令,将产生以下错误:
返回函数(*(wrapper_args + args)) TypeError:nll()缺少1个必需的位置参数:'b'
我到底在做什么错?我插入了b = 10对吧?
答案 0 :(得分:0)
optimize.minimize
期望其第一个参数是这种形式的函数:
def func(params, args):
...
其中params
代表optimize.minimize
试图最小化的所有参数。 args
可用于传递其他参数,这些参数不会被最小化。就optimize.minimize
而言,它们本质上是常量。
在这种情况下,params
代表两个值,a
和b
,所以像这样写nll
:
def nll(params):
a, b = params
...