我试图了解python的层次结构集群模块中的此链接功能的作用(无法从文档或其他更复杂的问题中了解)。
我尝试了一个带有随机向量的示例。我不知道从哪里开始计算这是什么,为什么链接中有12个数字,它们是什么?
谢谢
dist_vec=np.random.randint(1,10,6)
print dist_vec
[4 2 2 6 5 1]
# create linkage
Z = linkage(dist_vec, method='single')
# distance = 0.8 as cutoff
clusters = fcluster(Z, 0.8, criterion='distance')
print Z
[[ 2. 3. 1. 2.]
[ 0. 4. 2. 3.]
[ 1. 5. 4. 4.]]
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输出格式在scipy文档中进行了说明。
这是两个集群ID,高度和点数。
我强烈建议从2d欧式玩具数据开始。不是随机距离矩阵(这将是不一致的)。